随着高等教育管理体制改革的不断深化,高等院校办学规模得到迅速扩大,办学程度逐步加深,资金的流动量迅速增加,经济效益地位也日益突出。我国高等院校预算绩效评价仍然存在许多问题,如资金的投入与产出不相符,学生培养成本膨胀,负债率偏高,资金使用率不高等,在这种状况下,既要保证各项工作的顺利完成,又要完成特定的教育事业发展的目标,对此必须采取有效的措施,提高资金的使用率。我国高等学院对预算绩效评价体系,需要深入进行研究。　　本文首先介绍了高等院校预算绩效评价的内涵与理论基础以及我国高等院校预算绩效评价存在许多对预算绩效评价重视不够、缺少应有的法律和制度保障、未建立科学、规范、合理的预算绩效评价体系、预算绩效评价缺乏监督机制等问题。然后,针对高等院校预算绩效评价中存在的问题,绩效评价在高等院校预算管理中的作用,平衡计分卡在高等院校预算绩效评价应用中的可行性分析,以及平衡计分卡的设计原则,同时结合平衡计分卡的相关理论,提出了高等院校预算绩效评价是一种投入与产出效率及其效果的衡量,应当构建综合的绩效评价体系。再次针对高等院校预算的绩效评价指标进行深入研究,为我国高等院校的日常预算管理和学校事业的健康发展提供理论和方法上的支持,提出了适合我国高等院校实际情况的,基于平衡计分卡(Balancedscorecard,简称BSC)的预算绩效评价指标,并且在解决平衡计分卡设计中指标体系权重的问题上,使用了层次分析法(Analytichierarchyprocess,简称AHP),因而减少了专家评价上的主观因素影响,使平衡计分卡的评价结果愈加合理化,保证专家判断方面的一致性,可以直接利用层次分析法所修正过的专家的评价结果对相关指标进行综合绩效评价。最后对A高校预算绩效评价进行了案例分析,并结合该高等院校预算绩效评价中存在的问题提出了对策建议。