纵观生物制药行业的发展,不论是上世纪八十年代第一个五年计划的诞生,还是最新的第十三个五年计划的提出与实施,国家对引导生物制药行业发展的力度逐年增强,税收负担与一个行业的利润和发展息息相关,所以随着生物制药行业的发展,行业的税收负担问题被日益关注。本文以税收负担和税收负担的影响因素相关理论为基础,结合生物制药行业的特点及现状,深入分析影响生物制药企业税负的因素。文章主要采用数理统计方法,借助Eviews软件,选取2012-2016年在我国沪深股市上市,具有代表性的38家生物制药公司作为研究对象,选取企业的资产规模、负债水平、资本密集程度、盈利能力、研发支出处理、股权结构、企业股权性质、高管激励政策、内控水平作为解释变量,选取生物制药企业实际所得税税收负担为被解释变量,建立固定效应模型。通过实证分析得出结论:生物制药企业的资产规模、资产负债率、净资产收益率、资本化支出强度、国有股比例、高管持股比例都与企业的实际税收负担水平呈现出显著的相关关系,这些显著相关关系中,与实际税收负担水平呈显著的负相关关系的有资产规模、净资产收益率、资本化支出强度、高管持股比例,与实际税收负担水平呈显著的正相关关系的是资产负债率和国有股比例,而固定资产比例、第一大股东持股比例和内控水平与因变量实际所得税税负间的相关关系并不显著。这些解释变量中,代表盈利能力的净资产收益率和资本化支出强度两个解释变量对实际所得税税负影响程度最大。根据各解释变量对实际所得税税负的影响,本文对减轻生物制药企业税收负担从六个方面提出相应对策与建议:扩大资产规模,提高生物制药企业盈利能力,提高经营管理水平和税务筹划水平;重视研发开支,增加研发支出资本化投入,一方面无形资产的形成有利于提高企业盈利水平,另一方面企业也可以充分利用加速折旧的税收优惠政策;优化资本结构,合理调整负债水平;第四,增加固定资产和无形资产投入;合理运用高管激励政策,充分调动管理层积极性;合理运用税收优惠政策。