基于多尺度注意力机制的三维肝胆管图像分割算法研究

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肝胆管结石病是肝胆外科的常见病,是造成我国非肿瘤性胆道疾病死亡的主要原因。肝胆管结石的取石治疗主要依靠微创外科手术,如经皮肝胆道镜技术取石手术,需要依赖术前对病人腹部增强CT扫描片的影像分析,以确定肝胆管中的结石所在。由于肝胆管和肝内血管距离较近,容易错误穿刺到肝内血管而导致大出血。目前,对腹部CT图像中胆管及结石的所在位置依靠放射科医生主观评估,这有可能受到医生经验的影响。因此,探究一种对CT图像中的肝胆管进行自动分割非常有必要。本文的主要内容如下:与广州医科大学附属第一医院合作,利用该院肝胆外科收集的肝胆结石病增强CT门静脉期的影像数据,建立了一个自有数据集。使用ITK-SNAP对原始病例数据标注,严格筛选了21个病例用于训练,共3744张切片图像,测试集为5个病例,共891张切片图像。本文提出一个基于残差卷积多尺度注意力分割算法。利用编解码网络结构自动挖掘肝胆管特征的内在联系。为了兼顾肝胆管的形状及边缘信息,在跳连接设计一个基于Transformer结构的多尺度自注意力模块,整合来自不同特征层的特征信息,学习它们之间的联系,用于优化肝胆管的分割结果。本文进一步改进特征提取网络。使用了分组卷积和深度卷积,使得网络可以有更大的感受野,结构更加灵活。上采样和下采样与特征学习模块解耦,灵活搭配特征模块的数量。改进了多尺度注意力模块,更加高效地处理来自三个不同特征层的肝胆管特征,弥补跨层级特征融合的割裂性。为了更加聚焦肝胆管的边缘特征信息,提出了一种边缘聚焦的重叠度交叉熵损失函数,有利于在模型训练过程中,让网络更加关注胆管的边缘特征,有效提高分割准确率。实验结果表明,所提出的两种3D肝胆管图像分割方法均取得了较好的结果。而基于多尺度融合策略的自注意力分割网络在独立的测试集上,骰子相似系数(DSC)、豪斯多夫距离(HD)评估结果分别为76.35%、6.67,对肝胆管的分割效果在边缘聚焦以及重叠度上比现有网络的效果更优。
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