随着中国医药市场愈来愈融入国际医药大市场中，中药正面临着强大跨国医药集团的激烈竞争，而我国传统中药产业的众多产品，由于尚不能符合国际医药市场的标准和要求，在国际草药市场的销售份额不过百分之几。因此，必须依靠现代科学技术，努力开发中医药这个伟大宝库，通过创新中药和保健品的研发，更好地满足人民健康、保健和经济建设的需要，同时，通过现代的分析技术对其质量及活性成分进行分析，保证其质量可靠、安全、有效。　　 本论文介绍了色谱、质谱及其联用技术在中药及保健品研发中的应用，包括:(1)液质联用技术在中药质量控制方面的应用;(2)应用液质联用技术实现中药有效成分的快速定量分析;(3)应用光谱、色谱、质谱及其联用技术分析保健食品的有效成分。具体研究内容如下:　　 首先，应用超高效液相色谱-质谱联用技术，对人参、红参的皂苷类成分进行指纹图谱分析，建立了快速鉴定人参、红参样品的分析方法，并对红参蒸制过程中化学成分发生变化的规律作出了解释。本方法快速，简便，特征性强，重现性好，谱峰信息丰富，为道地中药材快速鉴定提供了新方法。　　 第二，以薯蓣皂苷为内标化合物，建立了串联质谱测定黄芪中黄芪甲苷含量的定量分析方法。该方法，在线使用一个色谱保护柱除掉大部分干扰性成分，同时使目标化合物富集，并采用多反应监测(MRM)扫描模式进行质谱定量分析。结果表明，黄芪甲苷的标准曲线线性关系良好。表明该方法可以对黄芪样品中的黄芪甲苷进行快速定量分析，简单、高效、灵敏。　　 第三，应用色谱、质谱及其联用技术，以及紫外-可见光谱等现代分析手段，分析敖东大高酵素保健品中的总糖、总皂苷、总黄酮、原花色素、氨基酸等功效成分，阐明了敖东大高酵素保健食品的化学物质基础。