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本文利用ISSR分子标记技术研究了新疆球蜡蚧属（Eulecanium Cockerell）6种蚧虫的种间亲缘关系及枣球蜡蚧（Eulecanium gigantea (Shinji)）不同种群的遗传多样性、遗传变异程度及其影响因素，根据Nei’s遗传距离用UPGMA法对种群进行聚类分析，主要研究结果如下：1.通过优化得到的ISSR-PCR体系，应用于球蜡蚧属蚧虫PCR扩增，得到的结果稳定性和可重复性较好。2.用本实验筛选出的37条引物对球蜡蚧属6种蚧虫的遗传多样性和亲缘关系进行了分析：蚧虫多态位点百分率为70.79%，Nei’s基因多样性指数平均为0.2925，Shannon信息指数平均为0.2839；各蚧虫遗传多样性变化趋势：枣球蜡蚧>黑条球蜡蚧（E. nigrivittaBorchsenius）>日本球蜡蚧[E. kunoensis (Kuwana)]>长球蜡蚧[E. douglasi (Sulc)]>扁球蜡蚧[E. ciliatam (Douglas)]>津球蜡蚧（E. circumfluum Borchsenius）。蚧虫Nei’s遗传距离在0.3733～0.6087之间。用UPGMA法对蚧虫进行聚类分析，结果表明ISSR分类结果与传统分类的结果基本一致，6种蚧虫被分为三类，Ⅰ类：枣球蜡蚧；Ⅱ类：津球蜡蚧、黑条球蜡蚧和扁球蜡蚧；Ⅲ类：日本球蜡蚧和长球蜡蚧。3.用实验筛选出的46条引物对枣球蜡蚧在新疆的15个不同地理种群的遗传多样性和遗传结构进行了分析：多态位点百分率为85.7%，Nei’s基因多样性指数为0.3346，Shannon信息指数为0.4256，表明枣球蜡蚧在物种水平上具有较高的遗传多样性。15个种群间的Nei’s遗传距离变化范围在0.01～0.17之间，遗传分化系数Gst表明有64.63%的遗传变异存在于种群之内，基因流为0.9136。UPGMA法聚类分析结果表明：165个个体被分为五类；叶城-墨玉种群亲缘关系最近，种群分化时间最短。4. SPSS相关性分析结果表明，枣球蜡蚧种群的遗传多样性与年均温度、年均湿度呈正相关，与寄主树龄和纬度无相关性，而与海拔呈负相关；各种群两两之间的遗传距离与年均温度差呈正相关趋势。5.用实验筛选出的18条引物对生活于新疆哈密地区榆树、槐树、枣树上的枣球蜡蚧种群间亲缘关系和遗传变异程度进行了分析：枣球蜡蚧多态位点百分率为88.13%，Nei’s基因多样性指数为0.2280，Shannon信息指数为0.3186。遗传多样性趋势为：枣树>国槐树>榆树。3个种群间的Nei’s遗传距离在0.063～0.100之间。Nei’s遗传分化系数Gst表明有65.49%的遗传变异存在于种群之内，基因流为0.9488。用UPGMA法对3个种群进行聚类分析结果表明：榆树种群与槐树种群亲缘关系最近。