超市是一种普遍实行连锁经营方式的零售业态。将连锁超市引入农产品流通，使我国消费者购买频率最高的商品，在超级市场中得以实现。它对农贸市场是一个内容和形式上较完整的现代化替代。在这个发展过程中，农贸市场的农产品经营与消费需求和城市发展之间的矛盾日益显露和加深，超市的农产品经营比重日益提高，但尚未能够取代农贸市场成为农产品经营的主体。本文利用交易成本理论、规模经济理论、专业与分工理论，结合经济订货批量模型，对农产品连锁超市经营进行了成本效益分析。在此基础上，从描述我国农产品连锁超市经营的发展历程和现状入手，全面、系统的分析了阻碍我国农产品连锁超市发展的外在因素和根本因素。最后，结合国内成功企业的实践经验，从农业产业链模式的构建、配送中心类型的选择、农产品流通组织的培育等方面，对如何推进我国农产品连锁超市经营提出若干对策建议。在我国，连锁超市取代农贸市场的主导地位需要一个长期的过程，只能循序渐进，不可能一蹴而就。伴随着经济的发展，连锁超市必将取代农贸市场成为农产品的主要零售终端。