山、水、林、田、湖是一个相互联结、相互作用、相互演进的生命共同体。三峡库区就是一个山、水、林、田、湖等多要素构成的典型的生命共同体,各要素的动态变化影响整个生命共同体的协调发展及结构功能,并对长江中下游的生态安全与可持续发展有重要影响。本研究从《重庆统计年鉴》和《重庆水资源公报》收集基础统计数据;并将30米空间分辨率的TM影像结合监督分类和目视解译,获取土地利用分类数据;再通过DEM获得平均海拔、坡度等。根据山水田林湖生命共同体的概念内涵,主要在山体结构、水体流量、森林功能、农业生产、河湖环境、人类生活这六个方面,构建基于山-水-林-田-湖-人的指标体系模型。同时选取系统聚类分析作为研究方法,分别对2003年和2015年重庆三峡库区山水林田湖生命共同体的健康状况、格局进行诊断。最后将这两年重庆三峡库区山水林田湖生命共同体的健康状况进行对比分析。2015年的健康诊断结果表明:万州、涪陵、云阳、开县、巫山、忠县、奉节、丰都、武隆、石柱、长寿、渝北、巴南、江津、北碚属于健康区;沙坪坝、南岸、九龙坡、大渡口、江北属于不健康区;巫溪是轻度病态区。2003年的健康诊断结果表明:南岸、九龙坡、大渡口、江北、涪陵、忠县、长寿、渝北、巴南、江津、北碚属于亚健康区;巫溪是轻度病态区;万州、云阳、开县、巫山、奉节、丰都、武隆、石柱属于中度病态区。2003年至2015年的研究变化表现为:健康区城市由0个增加到15个;亚健康区城市由11个降低到0个;不健康区城市0个增加到5个;轻度病态区仍然是巫溪;中度病态区从8个减低到0个。总体上,重庆三峡库区山水林田湖生命共同体的健康状态有逐渐变好的趋势,这主要是因为田系统和人系统的健康状态变好。