论文部分内容阅读
2018年5~9月,北京市西城区五所学校先后共报告了 5起呼吸道感染集中发热疫情。为了解报告的5起疫情的流行病学和病原学特征,开展了现场调查,采集病例咽拭子标本,使用荧光定量PCR检测17种常见呼吸道病毒进行病原学筛查,对鉴定为人腺病毒(Human adenovirus,HAdV)阳性的标本进行病毒分离,并分别扩增六邻体蛋白基因Loop2区域、三个衣壳蛋白(五邻体基座蛋白、六邻体蛋白和纤维蛋白)基因以及全基因组序列全长,进行HAdV型别的初筛和确认,同时与Genbank数据库中国内外人腺病毒3型(Human adenovirus type 3,HAdV-3)流行株序列进行比对分析。结果显示,5起集中发热疫情的致病原均为HAdV-3。进一步研究发现,2004年至今我国流行的HAdV-3病毒株均属于Clade2进化分支,也是近年全球优势流行株。两个进化分支HAdV-3病毒株在基因序列水平上均高度保守。本研究为我国呼吸道HAdV防控,以及HAdV-3型疫苗研发提供了基础科学数据。人腺病毒可以引起多种疾病,并不时引发呼吸道疾病的暴发流行,为了了解人腺病毒在不同疾病病原谱中的检出情况,本研究对符合纳入标准的284个研究进行人腺病毒检出率的Meta分析,分析内容包括异质性检验、随机效应模型合并效应量、Meta回归、敏感性分析和发表偏倚分析。结果表明284个研究检出率波动较大、异质性较高,分别采用不同的方法降低或分析异质性:随机效应模型合并总检出率为4.21%(95%CI:3.80%~4.66%);亚组分析各组检出率分别为胃肠道疾病5.06%(95%CI:4.22%~6.06%)、呼吸道疾病 3.97%(95%CI:3.53%~4.46%)、儿童 4.50%(95%CI:4.06%~4.99%)、成人 2.09%(95%CI:1.22%~3.56%)、抗原检测 1.94%(95%CI:1.64%~2.30%)、核酸检测 5.82%(95%CI:5.21%~6.49%)、抗体检测 5.60%(95%CI:4.17%~7.48%)、中国东部地区 3.67%(95%CI:3.18%~4.24%)、中部地区 6.07%(95%CI:5.20%~7.08%)、西部地区 5.00%(95%CI:4.03%~6.18%)、≦1000样本量6.10%(95%CI:5.39%~6.91%)、>1000样本量2.66%(95%CI:2.32%~3.05%);Meta回归分析有显著性的因素为疾病种类、年龄、检测方法、研究地区和样本量,调整R2=37.15%。本研究提示,类似像HAdV检出率的研究,在异质性较大时,Meta分析对率的合并仍有待完善。不同疾病种类、不同年龄、检测方法、研究区域和样本量大小是引起异质性的部分原因。