稻米蛋白含量QTL的遗传效应验证与精细定位

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水稻(Oryza sativa L.)是人类主要的粮食作物之一,同时它还为世界半数以上人口提供能量来源,其重要性不言而喻。稻米的营养品质关乎以水稻为主要农作物地区人群的身体健康,其所含蛋白含量是评判稻米营养品质的要素之一。关于稻米蛋白含量QTL(quantitative trait loci,QTL)定位的报道与日俱增,但目前通过自然变异图位克隆得到的控制蛋白含量的基因只有两个——Os AAP6和Os Glu A2,其余多为通过突变体研究所得。随着生物信息学日渐崛起,随之产生的基因芯片技术为QTL定位和基因克隆带来了极大的便利。本研究利用两个F2群体,定位到多个控制稻米蛋白含量的数量性状位点,继而对所有QTL进行遗传效应验证,并对其中一个QTL进行了精细定位,结果如下:1.利用籼稻品种Pusa分别和两个两系不育系H2613S,C815S产生的F2群体,借助近红外和凯氏定氮法检测其蛋白含量,再结合由RICE6K芯片基因分型所构建的遗传连锁图谱,最终共检测到四个控制蛋白含量的QTL。2.2018年夏天,在检测到的QTL区间两侧寻找SSR、SNP标记,对两个群体的四个QTL分别发展对应的BC1F5分离群体验证其遗传效应,最终验证到两个差异达到极显著水平的QTL——q PC2、q PC4。通过加密标记局部作图,结果分析发现qPC4存在两个LOD值大于2.5的QTL,分别命名为qPC4.1、qPC4.2。3.2019年夏天,我们在武汉种植qPC2的100个重组单株进行后代测验,通过精细定位,最终将候选区间定位到570kb。
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