芥蓝CRISPR/Cas9基因编辑体系建立及BocAOP2s的功能初步验证

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huhaiyan1953
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芥蓝(Brassica olearcea var.chinensis Lei)属芸苔属,是我国华南地区特色蔬菜之一,具有很高的营养价值,含有丰富的硫代葡萄糖苷(Glucosinolate,简称硫苷)。硫苷是一种重要的植物次生代谢物质,参与植物抗逆、抗病虫等应激反应,其中的萝卜硫苷(RAA)有很强的抗癌作用。在硫苷合成的关键基因位点GS-AOP存在AOP2基因,该基因编码的蛋白酶催化4-甲基亚磺酰丁基硫苷(萝卜硫苷,RAA)转化为3-丁烯基硫苷(NAP),NAP进一步转化为有害的2-羟基-3-丁烯基硫苷(PRO)。抑制BocAOP2基因的表达,有望创制出有益硫苷RAA含量高且有害硫苷PRO含量低的芥蓝新材料。本研究通过参考芥蓝基因组和转录组数据克隆得到3个BocAOP2s基因(BocAOP2a,BocAOP2b和BocAOP2c),对其进行了序列和表达模式分析;在芥蓝中建立了CRISPR/Cas9基因编辑体系,并利用该体系对3个BocAOP2s进行定点编辑,以抑制该基因的表达。获得的主要研究结果如下:1.克隆了3个BocAOP2s基因及其启动子序列,分析了其序列特点(1)克隆得到三个基因的DNA和c DNA序列,BocAOP2a、BocAOP2b和BocAOP2c的CDS序列同源性达到87.21%,其中BocAOP2a和BocAOP2b相似性为93.21%;BocAOP2c比BocAOP2a和BocAOP2b分别缩短了51和52个氨基酸。(2)三个BocAOP2s属于2OG-FeⅡ_Oxy基因家族,与拟南芥中AOP2类似,其编码蛋白具有典型的2OG-FeⅡ_Oxy保守结构域,可能参与硫苷合成。三个基因与甘蓝、油菜、白菜的AOP2亲缘关系最近。(3)克隆得到BocAOP2a、BocAOP2b和BocAOP2c上游1587 bp、1591 bp和1406 bp的启动子区域序列。序列分析发现BocAOP2a启动子含有4个MYB结合位点,其中一个是光响应的MYB结合位点;BocAOP2b和BocAOP2c启动子含有3个MYB结合位点,其中BocAOP2c启动子含有一个黄酮类基因调节的MYB结合位点。2.分析了3个BocAOP2s的表达模式对BocAOP2s在不同组织部位、不同发育时期和不同处理条件下的表达模式进行了分析。BocAOP2a和BocAOP2b在各组织部位表达量均较高,尤其在花蕾或花薹外皮中表达量最高;随着植株的生长发育,3个BocAOP2s表达量逐渐上升,在果荚和种子中表达量最高;BocAOP2a和BocAOP2b在不同组织部位和不同发育时期表达量均高于BocAOP2c。伤害胁迫、低温处理和高温处理均能诱导根、茎和叶组织中三个基因上调表达;在响应不同胁迫的过程中,BocAOP2a和BocAOP2b的表达量较高,而BocAOP2c的表达量较低。以上结果表明BocAOP2a和BocAOP2b可能是关键的硫苷生物合成相关基因。3.芥蓝CRISPR/Cas9基因编辑体系的建立选择白化标志基因BocPDSs作为靶基因,构建pCACas-t RNA-sgRNABocPDSs-ABCD基因编辑载体,转化芥蓝。PCR检测后,得到18株转基因植株,其中11株表现出易于识别的白化表型;对获得的转基因植株进行扩增区域的PCR产物测序,结果发现表现出白化表型的11株芥蓝植株都发生了基因突变,突变效率高达61.11%;其中BocPDSs基因序列出现了碱基缺失1次(7.69%),碱基替换2次,(15.38%),碱基插入8次(61.54%),组合突变2次(15.38%),说明CRISPR/Cas9基因编辑体系在芥蓝中成功建立。4.CRISPR/Cas9技术敲除芥蓝BocAOP2s基因构建了BocAOP2s的CRISPR/Cas9基因编辑载体,转化芥蓝。经PCR检测后,获得15株转基因植株;对转基因植株BocAOP2序列区域的PCR产物进行测序,发现有5株转基因植株发生突变,突变效率达到33.33%;其中2株发生了碱基缺失,2株发生了碱基替换,1株发生了碱基插入。对这5株转基因突变植株进行BocAOP2s及其它硫苷合成相关基因表达水平的分析,其中4株突变植株BocAOP2s表达量显著下调,其下游硫苷合成基因BocODDs的表达量也显著下调,说明BocAOP2s的功能可能已经被抑制,影响了下游基因的表达,暗示BocAOP2s参与芥蓝硫苷生物合成;其上游调控转录因子MYB28、MYB29的表达在其中两株转基因突变植株中发生显著下调,说明BocAOP2s可能对MYB28、MYB29转录因子具有一定的反馈调控作用,但是具体分子机制还有待进一步研究。转基因植株的表型和硫苷组分与含量分析还在进行之中。
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