ARMS与测序法检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的对比及其临床预测价值的研究

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目的在非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗中,表皮生长因子受体(EGFR)的基因突变状态是使用表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)疗效的重要预测指标,目前临床上没有统一的检测EGFR基因突变的方法。本文通过比较直接测序法和扩增突变阻滞系统(ARMS)方法,来探索适合我国临床上进行EGFR突变检测更加灵敏、准确、快速的方法并且研究不同的检测方法对使用EGFR-TKI临床疗效的预测。方法收集中山医院2008年到2011年3月临床医生推荐检测EGFR基因突变的NSCLC患者,通过直接测序法和扩增阻滞突变系统(ARMS)方法(ADx-EGFR 29,厦门艾德公司)检测这些患者手术或活检肿瘤组织标本中EGFR基因第18-21外显子的突变情况,并观察随访这些病人后续使用EGFR-TKI治疗的疗效情况,比较测序法和ARMS方法检测EGFR基因突变及对使用EGFR-TKI临床疗效的预测。结果共有364例患者入组,其中有344例患者进行了直接测序法检测,188例患者进行了ARMS法检测,两种方法同时检测的病人有168例。在两种方法同时检测的病人中,均检测到突变且突变结果一致者25例,结果不一致者3例,两种方法均无突变者107例,ARMS法检测到突变而测序法未检测到突变者29例,反之4例,两种方法有一定的一致性,但程度较弱(K=0.51,P〈0.01)。综合两种检测结果,最终确定有突变的患者为61例,测序法检测出32例,敏感性为52.5%, ARMS法检测出57例,敏感性为93.4%(P〈0.001)。29例ARMS法检测到突变而测序法未检测到突变患者中有10例复习原测序结果,发现因为突变峰低而判为无突变,其余19例重复两种方法仍然ARMS能检出突变但测序无法测出。另外,测序法检出2例ARMS试剂盒不包括在内的少数突变,还有一例由于ARMS引物结合问题没有检出突变。测序法检测突变率为19.0%, ARMS法检测突变率为33.9%,ARMS法的突变检出率要明显高于测序法(P=0.002)。在88例小标本中,ARMS法突变率42.0%要明显高于测序法19.3%(P=0.001),而80例大标本中两种方法检测突变率没有统计学差异(25% vs18.8%,P=0.339)。做过测序和/或ARMS法检测的病人共有107人规范二三线服用了EGFR-TKI并有随访的疗效评价。这些患者中,女性、腺癌和非吸烟者对TKI的疗效要优于男性、非腺癌和吸烟者。103例测序法检测病人中突变型患者的客观缓解率(ORR)和疾病控制率(DCR)分别为69.1%和94.5%,要明显优于测序法野生型患者的22.9%(P(0.001)和35.4%(P〈0.001),突变型患者中位无疾病进展时间(PFS)16.3个月(95%CI:12.8~19.8)也明显长于野生型患者的6.3个月(95%CI:3.7~8.9)(P<0.001)。47例有ARMS检测结果的病人中,突变型患者的ORR和DCR分别为78.3%和95.7%,要明显优于野生型患者的8.3%(P<0.001)和8.3%(P<0.001),突变型患者的中位PFS 17.5个月(95%CI:11.9~23.1)也明显长于野生型的1.7个月(95%CI:0.8~2.6)(P<0.001)。比较两种方法均检测的患者使用EGFR-TKI的疗效发现测序法野生型患者的ORR和DCR分别为25%和28.1%,而ARMS法检测野生型患者的ORR和DCR分别为8.3%(P=0.162)和8.3%(P=0.093)。ARMS法检测有突变但测序未检测出突变患者的中位PFS时间11.2个月(95%CI:7.2~15.1)要短于两种方法均检测到突变者21.0个月(95%CI:17.3~24.7)但长于两种方法均无突变者1.7个月(95%CI:0.8~2.6)(P<0.01)。通过ARMS法的突变Ct值和外控Ct值差值来量化肿瘤组织中突变细胞所占比例与TKI的疗效分析发现,随着疗效由CR、PR、SD、PD递减,Ct差值分别为6.09、7.10、7.66和8.19有增加的趋势,但由于样本量较小组间并无统计学差异(F=0.310,P=0.818)。另外,19外显子缺失突变和21外显子L858R突变两组患者的中位PFS时间没有统计学差异。结论ARMS法比测序法有更高的检测灵敏度和突变检出率,在小标本的检测中ARMS法较测序法优势史为突出,而且AMRS方法更加简单、快捷,适合在临床EGFR突变检测中得到广泛应用,并可以取代直接测序法。测序法可以检测出ARMS试剂盒内不包括的少见突变,结合两种方法检测结果更为全面可靠。无论是测序法还是ARMS法检测结果EGFR突变型患者均较野生型患者有更好的临床疗效。ARMS法检测EGFR突变的结果较测序法能更准确地预测NSCLC用EGFR-TKI的缓解情况。EGFR突变异质性对EGFR-TKI疗效产生影响,随突变型拷贝比例升高,使用EGFR-TKI的NSCLC患者PFS延长。19外显子缺失突变和21外显子L858R突变的患者在本研究中没有显示出使用EGFR-TKI疗效上的差异。
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