谷氨酸棒杆菌中蛋氨酸生物合成途径过表达及其竞争支路关键酶钝化

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蛋氨酸具有的多种生理功能,在食品、医药及饲料行业中具有较高商业价值。因其代谢调控复杂,一直不能发酵法生产,致使氨基酸生产企业和科研人员不断投入精力进行蛋氨酸菌种选育。菌种选育的研究思路基本包含两方面:一方面调控酶的基因表达量,通过启动子工程、动态调控等方法提高或降低基因表达量;另一方面改造酶的催化性质,由于蛋氨酸生物合成途径中多个关键酶受到严格的反馈调控,对酶的改造同样十分重要。本实验以谷氨酸棒杆菌为出发菌种,首先过表达天冬氨酸激酶(Aspartate kinase,AK)和高丝氨酸O-乙酰基转移酶(Homoserine acyltransferase,HAT)提高蛋氨酸合成的碳流量。其中AK是源于北京棒杆菌的单体酶,经本实验室改造解除赖氨酸和苏氨酸的协同反馈抑制,酶活为野生型的20-50倍。构建的工程菌经氨基酸产量测定,确定了赖氨酸是主要副产物。为了降低赖氨酸合成途径的碳通量,同时避免敲除该途径导致菌体死亡,选择对赖氨酸合成有重要影响的二氨基庚二酸脱氢酶(Diaminopimelate dehydrogenase,Dap DH)进行体外突变降低酶活,得到的数据为未来弱化赖氨酸途径奠定基础。研究结果如下:1.构建4株过表达AK和HAT的工程菌,提高了蛋氨酸的积累量。以野生型谷氨酸棒杆菌ATCC13032为出发菌种,分别过表达3个不同酶活AK突变体和AK-HAT共表达突变体,构建出4株重组菌,分别是Cg AK/p EC-NC、Cg AK/p EC-S59F、Cg AK/p EC-T65I和Cg AKM/p EC-T65I-met X并进行发酵测试。从转录结果上看,4株菌中AK和HAT的基因转录水平增大,证明成功电转后基因得到表达。从发酵产物上看,4株菌的蛋氨酸产量分别为2.84 g/L、2.92 g/L、3.04 g/L和3.29 g/L,是原菌的1.55倍、1.59倍1.66倍和1.79倍。发现过表达HAT后可以明显降低苏氨酸产量,但不是降低赖氨酸途径碳流的主要原因,为了更好地降低支路碳流,进一步研究赖氨酸合成途径的关键酶。2.构建了Dap DH野生型表达质粒,通过随机突变PCR和高通量筛选获得13个突变体,分别为D120N、D120R、D120T、G151Q、T169H、T169K、R195G、R195H、H244W、H244M、H244S、N270T和N270S。诱导表达和纯化WT Dap DH和突变体,经SDS-PAGE和Western blot验证Dap DH已在大肠杆菌中高效表达。3.对WT Dap DH和突变体进行酶动力学测定,13个突变体中6株突变体酶活增大,7株突变体酶活降低。D120位点、T169位点和R195位点的突变体酶活均低于Cg Dap DH,G151、H244和N270位点的突变体酶活均比Cg Dap DH增高。其中酶活显著降低的是T169H,是WT Dap DH的11%,Km值为29.91,与底物结合能力变差。此外,D120位点突变株酶活均有所下降,D120N下降最明显,是WT Dap DH的18%。酶活力可能受到关键残基侧链性质和与底物结合能力的影响。4.对WT Dap DH和突变体T169H、D120N进行分子动力学模拟,分析酶活降低原因,为日后的改造提供基础。结果表明T169H位点突变破坏了底物结合口袋的氢键网络,使底物不能稳定与酶结合,且突变后导致底物结合口袋结构的改变疏水微环境被破坏,在两方面共同作用下酶活降低。D120位于底物结合口袋入口,突变前通过侧链与附近螺旋上的残基形成氢键,稳定蛋白构象,同时在蛋白表面形成狭窄空腔,有利于底物以特定形态进入结合口袋。突变后120位点的氢键断裂,增大了底物口袋内溶剂可及面积,破坏疏水环境使酶与底物间相互作用力减少,由此降低酶活。
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