基于多组学数据研究BRD4基因功能和肾癌分子亚型

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:honest
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研究BRD4基因功能及肿瘤对BRD4抑制剂JQ1的耐药机制。研究肾癌的影像组学表型标志与临床特征的相关性,建立肾癌分子亚型判断模型;分析BRD4抑制剂JQ1药敏相关基因与放射组学特征的相关性。材料和方法:首先基于蛋白质组学数据库对BRD4基因功能进行分析,并通过EBI数据库中的系统生物学模型对BRD4的作用机制进行了论述,最后通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库对BRD4的功能和机制进行了细胞及组织水平的验证。基于GDSC和CCLE数据研究肿瘤对BRD4抑制剂JQ1的耐药机制。基于CT获得的宏观影像组学表型数据和微观的基因组表达谱数据,提取影像组学特征利用多层感知器神经网络(multilayer perceptron neural network,MLPNN)方法建立肾癌临床指标预测模型和肾癌分子亚型判断模型,研究肾癌的影像组学表型标志与肾癌的预后、分期、病理分级等临床特征的相关性,建立肾癌分子亚型判断模型;分析了放射组学特征与BRD4抑制剂JQ1药物敏感性基因表达的相关性。结果:首先验证了BRD4基因和转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)通路及细胞周期密切相关;提出并阐述了BRD4通过表观调控TGF-Β通路的SMAD3磷酸化,调控细胞周期,导向TGF-Β通路的致癌和抑癌作用的分子机制。结合药物组学数据,我们还找到了TGF-Β通路关键分子的表达可能是影响肿瘤细胞对BRD4抑制剂JQ1敏感性的原因。我们发现肾癌的影像组学表型标志不仅与肾癌的预后、分期、病理分级等临床特征相关,基于影像组学特征利用MLPNN建立的肾癌分子亚型判断模型能够较准确的实现宏观放射影像标志识别肾癌分子亚型的目的。部分与JQ1药物敏感性相关的基因表达与放射组学改变存在相关性。结论:在分子层面找到了决定TGF-Β通路两面性的又一关键分子BRD4基因,也部分的解释了TGF-Β通路既体现致癌作用又是抑癌的关键途径的可能原因:即BRD4通过表观调控TGF-Β通路的SMAD3磷酸化,调控细胞周期,导向TGF-Β通路的致癌和抑癌作用的分子机制。TGF-β通路与BRD4抑制剂JQ1敏感性相关。基于影像组学特征利用MLPNN建立的肾癌影像表型标志判别模型能够区分肾癌的预后、分期、病理分级等临床特征,实现识别肾癌分子亚型。肾癌放射基因组学能够发现影像学表型与BRD4基因及其抑制剂药敏相关基因表达的相关性,可能成为指导BRD4靶向治疗的方法。
其他文献
身着雪白的外衣,头顶竖着一对三角形的耳朵,两只圆溜溜的眼睛炯炯有神。嘿嘿,这就是我家的小猫小白!
水晶,大自然的精灵,晶莹剔透犹如颗颗凝冻的露珠,照亮了女人美丽的心情。它不像钻石那样灼人眼目,也不像珍珠那样温文平和。它散发着林间仙子的灵动和活泼,赋予了美丽新的含
咽津益寿;有益健康的小动作;精神健康的标准;冠心病的危险因素;吃橘子也要洗;艾滋病不存在父婴传播;……
对不少女孩来说,能成为演绎万种时尚风情的广告模特或影视明星,无疑是个遥不可及的梦,不过,随着全球最大的星探公司“奥普逊”进入中国,普通人成为“星”的机会迅速布满了大
Setting up a knowledge base is a helpful way to optimize the operation of the polyethylene process by improving the performance and the ef ciency of reuse of in
太阳落山之后,他们来了,亮品晶的,是谁呀?他们呀,是月光娃娃。月光娃娃很调皮,你想拉他们的手,怎么拉也拉不着,但他们的手想摸你,一摸就摸到。这还不算。月光娃娃摸你不是逗你玩,是想叫
Kansas City, Missouri, is not a place most Americans would consider a trend setter. But amid surging global enthusiasm for electric vehicles (EVs), this midsize
Materials development has historically been driven by human needs and desires, and this is likely to con- tinue in the foreseeable future. The global population