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恒河猴是人类疾病研究中最重要的实验动物之一。其Mamu分子在免疫系统中十分重要,尤其在抗原肽识别与呈递中发挥着核心作用。因此,在AIDS等病毒性传染病、组织器官移植、自身免疫病、慢性病和神经性疾病等相关研究中,需要大量已知其Mamu-B基因型的恒河猴。目前印度恒河猴的供应量远远不能满足科研的需要。中国恒河猴与印度恒河猴都是恒河猴的亚种,其免疫遗传系统十分相似,有可能替代印度恒河猴成为主流的实验动物。但是中国恒河猴的Mamu-B基因分型研究十分滞后,因此本文采用克隆-测序的方法对来自广西的中国恒河猴进行了Mamu-B基因分型研究。
本文共对22只中国恒河猴的Mamu-B基因进行了分型研究。分型得到67个Mamu-B等位基因。其中12个与已经公布的印度恒河猴的Mamu-B基因序列相同,另外55个是在中国恒河猴中发现的新的Mamu-B基因型。
经过对测序结果的分析,我们发现中国恒河猴Mamu-B基因的多态性主要集中于α1结构域和α2结构域。同时发现,α1结构域和α2结构域的ω(dn/ds)大于1,α 3结构域的ω(dn/ds)小于1。这说明α 1和α 2结构域的进化明显受达尔文正选择的影响,而α3 结构域受负选择的影响。Mamu-B 基因各结构域多态性与进化方式的特点与它们的功能是相符合的。
最后,我们分析比较了中国恒河猴和印度恒河猴的 Mamu-B 以及食蟹猴的Mafa-B 分子B、C、D、F口袋中氨基酸的分布与频率。发现中国恒河猴与印度恒河猴的Mamu-B分子在“口袋”处的氨基酸十分相似。比较的结果说明,中国恒河猴在识别与呈递抗原肽的性质上可能与印度恒河猴相似。但是,确切的结论还需要对Mamu-A等基因进行分型研究,更需要免疫学实验的直接证实。
综上,本文首次对中国恒河猴Mamu-B等位基因进行了系统的分型研究。研究了该基因的多态性分布,进化方式,定义了三个Mamu-I基因。并将中国恒河猴与印度恒河猴、食蟹猴相互比较,进行了系统发育分析,对中国恒河猴Mamu-B基因的抗原肽结合特性进行了初步的预测。本文的工作为后续寻找中国恒河猴能呈递的HIV、HBV等病毒的抗原表位奠定了初步的基础。