先天性心脏病患者CHD7基因突变的研究

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先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)是一种最常见的出生缺陷,是严重危害婴幼儿健康的先天畸形,在新生儿非感染性死亡疾病中占首位。先天性心脏病的病因目前还不能完全阐明。随着分子生物学和细胞遗传学的发展,不仅让我们更深一步地认识到CHD的病理发展过程,还意识到遗传因素是CHD发生的主要原因。目前发现的导致CHD的主要染色体畸变区位于1、3、4、8、11、22号染色体上。CHD7(chromodomain helicase DNA-binding protein gene)基因位于8q12.1,编码一种核蛋白,属于转录基因的激活子。已有报道证实在CHARGE综合征中,CHD7基因病理性突变会产生截短的CHD7蛋白,造成CHD7蛋白单倍剂量不足而引起一系列先天异常,其中心脏病约占85%。因此了解CHD7基因与散发性心脏病之间的关系,可以为心脏病的诊断与治疗提供参考依据。   本研究的目的是在筛查先天性心脏病患者CHD7(chromodomain helicaseDNA-binding protein gene)基因的胚系突变的基础上,探讨其在先心病发生中的作用。   研究方法:共收集524例临床确诊的先天性心脏病(Congenital Heart Disease,CHD)患儿、496例正常对照的外周静脉血,提取白细胞基因组DNA。采用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增,变性高效液相色谱分析技术(DHPLC)对其中67例CHD患儿、100正常对照进行了CHD7基因15个外显子的基因变异筛查。出现异常峰型的扩增片段进行DNA测序,明确突变位点和类型,并进一步扩大病例、对照样本,以及生物信息学分析探讨变异的功能意义。   实验结果:在先天性心脏病患者中共检出7种单碱基的替换,位于CHD7基因的不同内含子。其中,IVS11+127A>G和IVS12+21T>G的等位基因频率均为0.0075,为罕见变异;而IVS2+34G>A、IVS4+39G>A、IVS12-5T>C和IVS16+51C>A等位基因频率为0.2635、0.2156、0.1505、0.3636,属于单核苷酸多态性;IVS12-5T>C在CHD组的检出频率显著低于正常对照组(5.42%vs.9.57%,P<0.05);而IVS14-35C>G则仅见于CHD患儿。生物信息学分析显示,IVS12-5T>C替换具有增强外显子剪切的效应。   结论 CHD7基因单核苷酸多态性变异IVS12-5T>C对先心病的发生可能具有保护作用,而CHD7基因的突变可能并不是构成散发性先天性心脏病的主要原因。
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