高校合并后，图书馆馆藏资源总量增加，人才队伍得到了壮大，但随之也出现了用户需求发生变化，分编数据格式不一，多个图书管理系统并存，机构设置重叠等问题，且绝大部分高校呈现多馆并存的局面，图书馆资源整合问题是目前高校图书馆必须积极思考并解决的问题。首先，本文选择了南京市三所高校图书馆作为重点调查对象，通过调查问卷、网络调查和面对面访谈的形式收集数据，并对调查结果进行统计分析。然后根据调查问卷数据对南京地区合并高校的图书馆资源利用和用户反馈情况进行了实例研究。本文采取数据挖掘思想从深层次、多角度进行分析，分析出了合并后图书馆的资源利用情况和用户期望图书馆改进的服务，以及用户可以接受的提高资源利用率的改进方案。第二，基于文献调研和分析，进一步提出了高校合并后图书馆资源整合方案。本研究一是确立了图书馆合并后的管理模式，比较了一馆制、联邦馆、总分馆的优缺点，同时考虑到院系资料室的特殊性，最后制定了“总分馆+专业分馆”这一适用面最广的管理模式，同时，本着机构精简的原则设立相关隶属机构，并引入了人力资源管理的相关理念。二是探讨了如何整合硬件设施资源，从服务器整合、网络整合、存储方案选择等几方面分别进行了论述，并介绍了国内外最新的相关技术和使用方法。同时，根据合并后图书馆的需求和现有图书馆自动化管理系统的特点，制定了选择自动化管理系统的标准和根据标准进行综合评估的方法。三是针对纸质馆藏资源和电子馆藏资源的特点提出了详细的整合方案，其中包括书的剔旧、索书号的统一、各校区纸质资源的馆藏布局的调整、如何选择和购买数据库、基于OPAC整合电子资源、建立数字资源导航和选择跨库检索系统等一系列具体可行的实施方案。四是根据图书馆多馆并存的局面，对“通借通还”这一特殊服务形式做了详细的论述。以南京地区“211工程”的几个多校区学校为研究对象，针对目前以多校区图书馆“通借通还”这一服务方式的不足之处提出了相应的改进方案。本文力求结合实际，对高校合并后图书馆资源整合方案做了系统的分析，并对各建议方案进行了可行性论述，对高校合并后图书馆资源整合建设以及多校区图书馆各分馆间的资源共享具有重要意义。