政府机构改革分为中央机构改革和地方政府机构改革，如果说中央机构改革是一种宏观层面的结构调整，那么地方政府机构改革应该说是中观层面的管理改革。相对于中央政府，地方政府在实行机构改革时，一方面需要注意宏观政策与当地实情的配合，另一方面还需要注意中央与地方关系的调整。在中国处于经济社会转轨的背景下，地方政府机构改革需要处理好与财政体制和行政体制改革的关系，这使地方机构改革在政策制定和实施过程中都显得复杂而缓慢。制度已经成为一种内生变量必须被考虑到地方机构改革当中，而因改革引发的利益关系的调整，是地方机构改革成败的关键。本文以制度环境作为研究的背景，在回顾地方政府机构改革历程的同时，从制度经济学和转轨经济学的理论出发，首先表明是由体制压力引发地方政府机构改革，地方机构改革在不完善的体制背景下进行，也就意味着是在没有理顺的利益关系下进行；其次我们分析了地方机构改革本身也必定会对已有的没有理顺的利益关系进行再次调整，于是，对利益的两次触及却又没有适当的缓和利益矛盾的政策出台两个原因使地方机构改革少有成效。随后，本文又通过一个失败案例和两个成功案例证实了对利益的调整是地方政府机构改革的关键，并针对这一点提出了一些政策建议。本文的创新点在于：提出了对利益合理调整应当在两个范围之内，一是利益的最终格局要被利益集团所接受，结果在其可承受范围之内：而是利益的调整幅度必须被触及利益调整的集团接受，也就是过程在其可承受范围之内。于是地方政府需要在改革同时配合更多的完善利益调整过程的制度，地方政府机构改革才会趋向预定的改革目标。