鸡球虫E.tenella叶酸合成途径关键酶PPPK-DHPS cDNA的克隆及其株间变异研究

来源 :湖南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kejianghaoxl
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本研究通过生物信息学方法对鸡E.tenalla叶酸合成途径关键酶PPPK-DHPS基因(pppk-dhps)进行了预测,用RT-PCR的方法获得鸡E.tenalla pppk-dhps的ORF。结果显示鸡E.tenella pppk-dhps基因ORF为2001 bp,G+C含量为51.92%,共编码666个氨基酸,大小约为74.3 Kda,无信号肽。通过生物信息学方法对鸡E.tenalla PPPK-DHPS进行结构和功能分析,结果显示,鸡E.tenallaPPPK-DHPS为一双功能酶,同时具有PPPK和DHPS功能区,并与其它原虫间具有高度保守性,序列相似性达到22.1%-38.5%,共有19个高度保守的序列模块,且顺序正确,无重叠,匹配度高,鸡E.tenalla PPPK-DHPS折叠类型也与其它生物相似。通过RACE方法,我们获得了鸡E.tenalla pppk-dhps全长cDNA,其长为2372 bp,5’和3’非编码区分别为244 bp和127 bp,与刚地弓形虫和恶性疟原虫pppk-dhps全长cDNA序列进行比对分析,结果显示三者非编码区存在较大差异,刚地弓形虫非编码区明显长于其它两种原虫,尤其在其3’端。对鸡E.tenella不同磺胺药敏感虫株和抗性虫株PPPK-DHPS进行株间变异研究,结果显示不同虫株氨基酸序列相似性为99.1%-99.9%,在我们的鸡E.tenella磺胺药敏感株和抗性株的pppk-dhps基因多态性分析中发现,磺胺药抗性株甘肃株和上海株在其DHPS功能区403位点存在Asp→Asn的变异,这与刚地弓形虫在DHPS功能区407位点Asp→Asn的变异相似,因此推测DHPS功能区403位点的突变与鸡E.tenella磺胺药抗药性的产生有关。
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