高原鼠兔bHPV相关基因的比较转录组分析与初步验证

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangtao7897
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慢性低氧暴露下,平原动物易产生低氧性肺血管收缩。与平原动物不同,高原鼠兔(Ochotona Cruzonia)慢性低氧胁迫下表现为肺血管收缩反应钝化(Blunted Hypoxic Pulmonary Vasoconstriction,bHPV)。作为一种特殊的生理适应机制,高原鼠兔bHPV相关关键基因及其表达变化仍知之甚少。本研究以平原动物SD大鼠为参照,采用比较转录组学和比较生理生化相关研究方法对低氧刺激下高原鼠兔肺组织基因表达进行种间和种内比较,以筛选与高原鼠兔bHPV的关键基因。主要研究结果如下:  1.模拟5000m海拔低氧处理7天(P5K1W组)和28天(P5K4W组),高原鼠兔平均肺动脉压(mPAP)分别为16.7±1.712mmHg和19.0±1.586mmHg,与低海拔(3200m,PCK)高原鼠兔mPAP(18.6±0.898mmHg)相比,无明显差异(P>0.05)。低氧处理下,P5K1W组和P5K4W组的右心指数(RV/LV)较PCK组有所上升,但P5K1W与P5K4W间无明显差异(P>0.05),且P5K4W较PCK上升不显著(0.2±0.004vs0.2±0.003,P>0.05)。大鼠随海拔的上升和低氧暴露时间的延长,mPAP和RV/LV均显著升高(P<0.01)。  2.随着低氧胁迫程度增强,高原鼠兔内源性NO水平下降,而H2S水平呈上升趋势;在SD大鼠,则NO呈上升趋势,而H2S呈下降趋势。结果描述了高原鼠兔内源性NO与H2S的含量特征和消长关系。  3.与PCK相比,在P5K1W和P5K4W中共同上调的基因有866个,共同下调的基因位8364个,富集趋势显著。上调与下调基因中,部分基因与肺血管动脉压调节密切相关,分别被富集到Vascular smooth muscle contract、HIF-1signaling pathway、Calcium signaling pathway、cGMP-PKG signaling pathway、PI3K-Akt signaling pathway等通路中。  4.间隙连接蛋白40(CX40)是肺血管收缩信号转导途径的关键蛋白,P5K4W和P5K1W组高原鼠兔CX40蛋白表达显著下降(P<0.05);而SD大鼠CX40蛋白表达无组间差异(P>0.05),提示CX40参与高原鼠兔bHPV过程,且其翻译过程受低氧调控。  本研究通过比较研究,从生理生化表征、转录组水平对高原鼠兔bHPV进行了解析并进行了初步验证,为进一步揭示高原鼠兔低氧适应的遗传学基础和关键基因奠定了良好基础。
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