肾组织中与狼疮性肾炎相关的失调基因生物信息学分析鉴定

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sdtt1314
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:狼疮性肾炎(Lupus nephritis,LN)是一种由免疫介导的复杂的器官炎症,其发病机制仍不明确。本文利用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库对LN患者肾小球组织的全基因转录数据进行生物信息学分析,挖掘与LN相关的基因、信号途径及转录因子,为今后对LN的研究奠定分子学基础。方法:1、在GEO数据库中联合GSE99339、GSE32591数据集进行LN相关差异基因表达分析和交集分析。2、使用Metascape工具对LN特异表达基因进行GO注释及和KEGG富集分析。3、使用STRING数据库识别LN特异基因的蛋白质相互作用并使用Cytoscape MCODE插件进行关键基因模块的筛选。4、通过KEGG,Reactome,HALLMARK信号途径数据库对LN特异基因进行富集分析,筛选出关键信号途径。5、使用TRUUST数据库寻找调控关键信号途径的转录因子。结果:1、LN组与正常对照组和其他肾病对照组相比,存在不同数量的差异表达基因,交集得到32个差异表达基因。32个基因在LN组中显著上调,在对照组中显著下调,作为LN特异性表达基因。2、LN特异表达基因主要富集在干扰素相关途径和丙型肝炎,甲型流感,麻疹,EB病毒感染等多种病毒感染过程中。3、Cytoscape MCODE插件在LN特异表达基因的蛋白质互相作用网络中,筛选出1个关键基因模块4、关键基因模块的基因显著富集在干扰素α,β及γ途径。5、TRUUST数据库显示STAT1,IRF1为3条信号途径的关键转录因子。结论:1、和其他对照组相比,LN组患者的肾组织中存在32个明显上调的差异表达基因。2、LN特异表达基因主要富集在多种病毒感染过程中,病毒感染和LN之间可能存在特定的联系。3、LN特异表达基因富集到的关键信号途径为干扰素α,β及γ途径。4、STAT1,IRF1为干扰素信号途径的关键转录因子,针对STAT1,IRF1的调控或可成为LN治疗的新靶点。
其他文献
自两千多年前佛教传入中国后,与中国的传统文化互交互融,对我国社会、经济、人文等各个方面产生了深远影响。本文是基于本人的现代舞作品《万相》而展开的一篇创作说明论文。通过阐释作品主线——佛教“世界生灭观”的基本观点,并结合作品中的肢体语言与服装道具的书面阐述与剖析,透视其背后的意象化表达。试图为现代舞的编创提供书面化的分析材料,促进艺术交流与学术分享,推动当代舞蹈创作的发展。
学位
近年来,国家教育政策以及新课标都在不断强调增强学生音乐文化素养的重要性,也在不断对于美育文化教育做出一些列积极的措施,其中特别是对于中小学基础音乐教育也有了许多明确具体的安排。在2020年全国教育工作会议上,教育部部长陈宝生表示:为了加强美育文化建设,必须要持续推进学生艺术素质教育评测,把学校美育工作纳入督导评估和考核体系,把“软任务”变成“硬指标”。在基础音乐教育的领域里,许多的音乐教育工作者都
在减税降费、“双循环”战略、“十四五”规划和二〇三五年远景目标背景下,财政赤字率、政府债务率、利率与汇率联动问题备受关注。融合不同理论模型,根据新中国72年月度数据,运用MSAR-TVP-VAR模型识别稳态区间,检验四者作用机制发现,财政赤字率上升推升政府债务率,政府债务率上升推升利率,利率上升促使人民币兑美元汇率下降。为稳定汇率,央行干预后,人民币兑美元汇率上升,促使利率下降,利率下降推升政府债
本研究结合普通PCR技术和Long PCR技术测定了弯弓蚌螨(U. arcuata)线粒体基因组全序列,该序列全长14574bp,A+T含量明显高于G+C含量,高含量的A+T是螨类生物线粒体基因组序列中普遍存在的现象。弯弓蚌螨COI基因全序列长1539bp,该基因共编码512个氨基酸,其中起始密码子为ATG,终止密码子为TAA, TGA编码色氨酸Trp而不是终止密码子,亮氨酸Leu的含量最高,半胱
子痫前期(preeclampsia,PE)是一种初发于妊娠20周后的多系统功能紊乱性疾病,全球每年约有5%-8%的孕妇受其影响,是导致孕产妇及新生儿病死的主要疾病,其临床表现主要为高血压及蛋白尿。虽然子痫前期的相关研究取得了重大进展,但目前对其病因学和病理学机制仍然知之甚少,已成为该领域亟待探讨的重大课题。在我们前期研究中,利用超高压液相色谱串联六级杆质谱技术建立了15-羟二十烷四烯酸(15-hy
“双减”政策的出台,给教培行业的激烈竞争按下了暂停键,资本市场看空、企业寻求出路、机构教师转行,传统以K12教育为主流业务的教育机构亟待转型,整个行业面临大洗牌。本文首先从“双减”前,整个行业市场规模扩大、教学技术变革、行业门槛提高的简况出发,与政策落地后的相应状况进行比对分析,从市场赛道切换、机构重心调整、个人职业转型三个层面,为“双减”格局下的教培行业的发展提供具有可行性的参考建议。
目的:探讨HSP22对糖尿病所致肾损伤中肾脏纤维化、氧化应激和组织损伤的作用和机制。方法:动物部分:1,利用STZ诱导二型糖尿病方法造模糖尿病小鼠模型,随机分为4组,分别为野生对照组(WT-control组)、野生糖尿病组(WT-diabetes组)、敲除HSP22对照组(KO-control组)、敲除HSP22糖尿病组(KO-diabetes组)。2,H&E染色和PAS染色观察各组小鼠肾组织的病
背景与目的:在临床诊疗中肾脏缺血再灌注损伤(Renal ischemia reperfusion injury,RIRI)是造成肾脏损伤的一种比较常见的病理过程,甚至是导致急性肾功能衰竭的主要原因之一。同时肾脏移植时,RIRI也影响供体肾的功能恢复和后期存活的重要因素。而且RIRI的病理生理机制非常复杂,到目前为止还没有完全弄清。本研究是通过建立小鼠肾小管上皮细胞缺氧/复氧模型,模拟体内肾缺血再灌
一、化肥减施增效技术1 施用油菜专用缓释肥。根据云南不同油菜生产区域气候特点、土壤类型和养分状况及施肥习惯,确定不同区域、不同土壤类型的推荐施肥量。滇东红壤区,缓释肥用量20~30千克/亩;滇中水旱轮作区,缓释肥用量40~50千克/亩;滇西砂壤土种植区,缓释肥用量35~45千克/亩。2.种肥同播推荐采用精量联合播种机播种,也可人工点播、
期刊