花生分子遗传连锁图谱的构建

来源 :大连工业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:onlysimon
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花生是世界重要的经济作物之一,是我国重要的食用蛋白源和食用植物油源,在国民经济中占有举足轻重的地位和作用。我国花生在针对产量、品质和抗性等复杂农艺性状的选择方面凸现的问题使常规育种技术捉襟见肘。利用先进的分子标记技术辅助育种是花生育种的重要趋势,而构建高密度的遗传连锁图谱是花生性状快速、定向改良的前提,是在分子水平上研究复杂性状的基础和保证。DNA分子标记技术的快速发展,为花生遗传连锁图谱的构建提供了更多的标记种类。本研究应用以SSR为主的包括AhTE、 ISSR、SRAP和SRAP-RGA的五种分子标记构建了一张花生遗传连锁图谱,成果如下:1、DNA提取方法优化:本实验对常规的提取植物基因组DNA的CTAB法进行改良和比较,探索出一套适合提取幼嫩花生叶片基因组DNA的提取方法。2、SRAP-RGA反应体系的优化:分别对Mg2+、dNTPs、退火温度、PAGE胶交联度4个方面进行优化选择,优化出适合本实验材料的SRAP-RGA反应体系。10μL体系中Mg2+浓度为2.0mmol/L, dNTPs浓度为250μmol/L, DNA为50ng,引物浓度为0.5μmol/L, Taq酶为0.5U,1μL10×PCR缓冲液(不含Mg2+)。PCR反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,45℃退火1min,72℃延伸1min,循环5次;94℃变性1min,50℃退火1min,72℃延伸1min,循环30次:最后72℃延伸10min。3、多态性引物筛选:对作图群体的两个亲本H22和D99进行了2172对SSR引物、528对AhTE引物、10个ISSR引物、460对SRAP引物及507对SRAP-RGA引物组合的筛选,共筛选出188对SSR引物、8对AhTE引物、1个ISSR引物、8对SRAP引物和8对SRAP-RGA引物组合在亲本和群体间表现多态性。4、遗传连锁图谱的构建:以H22和D99杂交获得的F2代94个单株作为作图群体,用筛选出的较好的多态性引物组合对F2群体单株的基因组DNA进行PCR扩增,共获得237个多态性标记。用Join Map40软件构建遗传连锁图,其中158个标记位点进入20个连锁群(LOD≥3.0)。遗传连锁图谱总长1170.1cM,每个连锁群有2-28个标记位点,最长的连锁群图距为251.2cM,最短的连锁群图距为6.8cM,标记间最大间距为73.5cM,最小间距为0.2cM,标记间平均间距7.41cM。
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