为了从分子水平调查中国细毛羊的遗传资源现状，掌握中国细毛羊的遗传结构及选育潜力，从而为制定科学有效的保种策略和品种培育规划提供理论依据。本实验以ABI3730XL全自动基因序列分析仪为平台，应用联合国粮农组织和国际动物遗传学会推荐的10对微卫星引物并结合荧光PCR技术，以中国美利奴羊（新疆型）、中国美利奴羊超细品系、新吉细毛羊、敖汉细毛羊、甘肃高山细毛羊、甘肃高山细毛羊超细型品系和青海细毛羊为研究对象，湖羊和凉山半细毛羊作为参照对象，对其进行了遗传多样性检测及分析，研究结果如下：1．10个微卫星位点之间是连锁不平衡的，且在9个绵羊群体中均表现为高度多态，可作为绵羊遗传多样性和群体间遗传关系分析的有效标记。2．7个细毛羊群体的平均多态信息含量为0.6938，杂合度均值为0.7353，平均等位基因丰富度为7.4343，表明被研究群体的遗传多样性较为丰富；哈代-温伯格平衡定律检验结果表明甘肃高山细毛羊超细型品系与中国美利奴超细型品系偏离平衡的位点数较多，分别为7个和5个。说明应适当加强群体的本品种选育或横交选育。3．采用非加权配对算术平均法构建的聚类图和采用主成分分析法得到的散点图均显示，细毛羊群体与湖羊和凉山半细毛羊为不同的2类；甘肃高山细毛羊和青海细毛羊的遗传距离较近；中国美利奴羊（新疆型）、中国美利奴羊超细品系、新吉细毛羊、甘肃高山细毛羊超细品系和敖汉细毛羊的遗传距离较近。说明群体的遗传结构比较清楚。4．遗传分化分析发现，7个细毛羊群体间的遗传分化系数（Fst）较低，均小于0.05，7个群体间存在较大的基因流，新吉细毛羊与中国美利奴羊（新疆型）之间的基因流为最大31.30，青海细毛羊与敖汉细毛羊群体间基因交流8.02，为最小，较大的基因流可能是导致各群体间遗传分化程度低的一个主要原因；各个群体内近交系数均为负值，表明群体内出现杂合子过剩的情况。说明实施联合育种与定向选育的作用明显。