东汉末期医家张仲景的《伤寒杂病论》是现存最早具备完整的理法方药体系的著作,其中一些2-3味药的小方或药物组合反复出现在其它方中。研究者将这些小方或药物组合命名为方元。本论文拟在进一步挖掘含两味药的方元的基础上,探讨这些方元在组合成方时所遵循的法则。经方的概念从“经验之方”变为专指《伤寒论》、《金匮要略》的“经典之方”,是因为这些方疗效卓著,沿用千年而不衰,还是许多时方之祖。以方元为核心研究经方的组方法则对临床准确而灵活地运用经方具有重要意义,也对扩大经方的使用范围、提高疗效具有现实作用,还对时方的配伍规律研究具有借鉴价值。首先建立经方的全方数据库,去除重方、单味药方以及遵循合方与核心方剂加减配伍方法的经方,通过比较主药和加减药味与主方的异同找出类方中与主方重合度较高的经方,与上述诸方(所有只含两味药的经方除外)一并从全方数据库筛除,并建立新的有效方数据库。其次统计有效方数据库中所用的单味药,选取任意两味药构成组合,运用Matlab计算重复组合和构成组合的药味的个数以及它们在有效方中出现的频次。分析单味药的频次与其构成的组合个数、重复组合与构成组合的两味药的频次、单个有效方中所含药味与组合的个数之间的相互关系。最后以单味药为纲,逐一分析由其构成的重复药物组合在所出现的经方中是否具有理论意义,找出具有理论意义的重复组合与其对应的方,即方元与对应的经方。比较含相同方元的经方在组方结构上的区别与联系,找出方元组合成方所遵循的法则。在排除了单方、合方,以及以核心方剂加减配伍方法组方的经方中与主方重合度较高的方后,建立了173首有效方的数据库,其中出现两次及以上的重复药物组合有356种。这些组合在所出现的经方中一部分完全是随意组合,一部分只在某些方中具有理论意义。以药物组合出现的频次为主要依据,综合考虑构成组合的药物频次、相关方的大小以及所含药物的频次,引入药物使用一致性指标等综合考察重复组合的可信度,可缩小方元筛选的范围。排除没有理论意义的组合以及不含这一配伍的方,得出有13首含两味药的经方、27组由两味药组成的配伍为构成多个经方的方元。小方类方元有：桂枝甘草汤、橘皮汤、小半夏汤(生姜半夏汤)、半夏干姜散、半夏麻黄丸、芍药甘草汤、枳实芍药散、甘草干姜汤、干姜附子汤、泽泻汤、大黄甘草汤、甘草麻黄汤、栝蒌牡蛎散。组合类方元有：桂枝-芍药、桂枝-桃仁、瓜蒌-薤白、桂枝-茯苓、半夏-人参、半夏-黄连、半夏-黄芩、芍药-当归、芍药-黄芩、干姜-人参、干姜-细辛、细辛-五味子、白术-茯苓、白术-附子、白术-川芎、茯苓-猪苓、黄芩-黄连、桂枝-附子、附子-细辛、大黄-桃仁、大黄-芒硝、大黄-甘遂、麻黄-杏仁、麻黄-石膏、当归-川芎、石膏-知母、柴胡-黄芩。方元组方的特点主要可总结为两点：一是同一治法的方元通过组合增效以适应病势的变化；二是不同治法的方元通过相互辅助来适应病性的复杂化。后者在经方中更为常见,在临床上也更具有指导价值。方元组方时常以某味药为核心,即使用多个含该药的方元或配伍,使得方剂的结构呈网络状趋势：例如桂枝茯苓丸方以桂枝为核心,由温经活血的桂枝-芍药和温阳利水的桂枝-茯芩、活血祛瘀的桂枝-桃仁的三个方元组成；小青龙汤可视作由半夏干姜散、半夏麻黄丸、麻黄-桂枝、桂枝-芍药、芍药甘草汤、甘草干姜汤、干姜-细辛、细辛-五味子等多个方元构成,几乎每味药都出现在至少两个方元中。可见以方元为核心分析经方更加能说明它们之间的联系与演变。比较同一方元构成的不同经方来看,方元在组方遵循的基本法则是使新的组方能适应病证病机的变化,新方的功效能与依据病机制定的相应治法保持一致。