基于转录组测序的毛白杨愈伤组织形成关键基因鉴定

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zkk81950868
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
杨树(Populus L.)是重要的绿化树种和造林树种,具有重要的经济价值与生态价值。杨树也是研究林木分子生物学的模式植物,前期研究发现不同杨树基因型的愈伤组织诱导率和分化率差异明显。本研究为探究毛白杨愈伤组织形成的分子机制,以毛白杨(P.tomentosa)、山新杨(P.davidiana×P.bolleana Loucne)、毛果杨(P.trichocarpa)为材料,通过不同时期愈伤组织的转录组测序,鉴定不同基因型杨树愈伤组织差异表达基因。结果如下:(1)分析毛白杨、山新杨和毛果杨叶片分化率和愈伤组织形成情况。结果表明,不同杨树的分化率和愈伤组织形成差异显著,毛白杨和山新杨容易分化、生根和形成愈伤组织,而毛果杨分化、生根和形成愈伤组织相对较难。(2)通过转录组测序,分别从毛白杨、山新杨和毛果杨愈伤组织中筛选出2880个、204个和918个差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs);通过GO(Gene Ontology)功能富集和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析,发现2条与愈伤组织形成密切相关的信号通路,分别是植物MAPK信号传导途径和植物激素信号转导途径;根据DEGs的保守结构域、分子功能和表达水平,筛选出25个与组织形成相关的关键候选基因。(3)用RT-qPCR验证转录组测序数据。结果表明,RT-qPCR验证结果与转录组测序结果一致;通过对比三种杨树中不同形成时期愈伤组织差异表达基因,筛选出Pto ARF3、Pto ARF5、Pto Ein3和Pto ARR2等4个愈伤组织形成的关键基因,并利用RT-PCR扩增从毛白杨中克隆出候选基因c DNA片段。Blast结果显示其编码蛋白与毛果杨具有较高的同源性,并成功构建了目的基因的植物表达载体。(4)用农杆菌介导的叶盘转化法培育出Pto ARF3、Pto ARF5、Pto Ein3和Pto ARR2等4个目的基因过量表达和雌二醇(XVE)诱导的RNAi干扰表达的转基因毛白杨。经PCR检测证明外源基因已经整合到毛白杨基因组;RT-qPCR基因表达定量和GUS染色证明外源基因能够在转基因毛白杨中正确表达。对转基因毛白杨分化率进行观察,发现Pto ARF3、Pto ARF5对毛白杨愈伤组织形成具有促进作用,而Pto ARR2和Pto Ein3对毛白杨愈伤组织形成具有抑制作用。
其他文献
在生态文明背景下,基于国土空间的生态修复研究成为国内外探讨的重要内容之一。如何进行生态修复区划和制定修复策略是开展生态修复的关键。湖北省大别山是我国主要的水土保持生态功能区和生态安全屏障,具有极高的生态价值。区域历史悠久、资源丰富,但由于受到人类活动的干扰,生态系统质量下降、功能退化等问题突出,需要科学地进行生态修复分区研究。本文选取湖北省大别山片区作为研究区域,运用通用土壤流失方程、水量平衡模型
学位
现代化农业的有序发展,是我国达成建成小康社会目标的基础条件。农科大学是培养农业科技人才的摇篮,培养出的人才在助力现代农业发展方面起到了不可替代的作用,对我国农业千秋发展大计更具有长远的发展意义。然而,受制于多种影响因素,包括就业服务、就业环境、产业发展、教育和政策等,农林高校涉农专业学生毕业后普遍流向其他非涉农产业,或者出现学农不涉农的现象。这些因素的存在影响了农科大学生的就业质量,延缓了现代农业
学位
随着高精度印刷设备的普及和网络传播技术的发展,数字产品的盗版现象日益严重,不仅侵害了版权者所有者的利益,也阻碍了数字出版行业的发展。如何对数字版权进行保护,是目前迫切需要解决的重点问题。采用微结构网点实现图像防伪,需要建立一个字符模板的字库,本文提出了一种半色调字符模板字库的自动生成算法。利用阈值矩阵法,实现了字符模板的自动生成;并利用膨胀、腐蚀等变换对字符模板进行纹理形态上的改变,得到形态各异的
学位
随着生活水平的不断提高,人们对药品等包装质量的需求越来越高,特别是包装盒中的产品数量也是生产企业关注的问题之一。目前,国内的多数药品生产行业一般采用人工抽检的方式对包装盒内的袋装药品数量进行检测。在采用人工对药品数量检测的过程中,其检测的结果极易受到质检员自身状况的影响,而且这种方式检测效率低、容易漏掉问题药盒,成本高,药品数量不能从根本上得到保证,针对药品生产线上包装盒内袋装药品漏装或多装问题,
学位
图像描述是一个涉及计算机视觉和自然语言处理两个领域的多模态任务。该任务的目标是希望通过自然语言处理技术生成准确描述图像内容的自然语句,同时该任务在视觉障碍、图文检索等领域有着广阔的应用前景。随着人工智能技术的快速发展,基于深度神经网络的图像描述算法凭借模型泛化能力强,生成描述更灵活等优点,成为了图像描述任务的主流方法。故本文针对基于深度神经网络的图像描述算法展开研究,具体研究内容如下:第一,针对基
学位
社区是人最基本的生活场所,是社会治理的根基和落脚点。西岗区是大连市老城区,老旧小区占比较高,随着建设年代的推移和城市化进程的加快,基础设施建设落后、公共服务配套滞后、物业服务缺失等问题成为这些小区的共性问题,已成为城市建设和治理的短板弱项;特别是新冠肺炎疫情在全国蔓延以来,社区作为基层治理单元在疫情防控与应对中发挥了重要作用,但同时也暴露出老旧小区在应对城市突发公共安全突发事件、自身应急能力薄弱的
学位
白桦是我国北方广泛生长的桦木科植物,具有抗寒性强、生长较快等特点,常用于高抗性优良品种的培育。近年来,白桦全基因组测序的完成,为研究木本植物抗性机制奠定了一定基础。长链非编码RNA(lncRNA)是一种不编码成蛋白质的RNA分子,其长度大于200个核苷酸,对植物内在机制有着重要的意义。目前lncRNA在医学及动物领域中的功能、作用机制等方面的研究较为深入,其不仅能够调控基因的表达,也参与诸多生命过
学位
随着全社会对收入分配制度改革的期待日渐强烈,个税改革的呼声也随之高涨,2018年8月31日,第十三届全国人大常委会第五次会议表决通过了修改个人所得税法的规定,自2019年1月1日起施行修改决议。在个人所得税政策改革的背景下,大连市在个人所得税的征收管理过程中存在的问题逐渐展露出来。本文从大连市个人所得税征收管理的现状入手,主要通过对大连市近五年的个人所得税收入的分析以及对现有的征管模式的分析,制定
学位
当今世界,以信息技术为核心的新一轮科技革命加速孕育兴起,互联网日益成为创新驱动发展的先导力量,有力推动经济社会发展,深刻改变着人们的生产生活。互联网信息治理关系到国内社会的稳定大局,关系到人民群众的切身利益。互联网的快速发展对政府治理及其执政能力等都产生了深刻影响,使得现有政府体系的固有缺陷日益凸显。在当前,如何加强互联网信息治理,成为地方政府推进网信事业的重要课题。本文运用公共管理的理论知识,以
学位
21世纪以来,随着经济的快速发展和企业核心竞争力的提高,传统的内涵增长模式已经无法满足越来越多企业的发展需要,经营者基于利益趋向,开始实施以并购为主的外延增长模式,企业并购活动频繁发生,并购审计业务日益增多,与之相伴相随的审计风险客观存在。理论的发展大多基于对历史经验的总结和对当下面临的问题寻求解决之道。本文以企业并购中的审计风险为主要研究对象,根据审计风险模型来分析影响企业并购审计风险的三个因素
期刊