CP4-EPSPS转基因蛋白的适体筛选与亲和性分析

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:wjz5201
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本文应用SELEX技术(指数富集配基的系统进化)对CP4-EPSPS转基因蛋白进行适体筛选,旨在筛选出能与该靶目标具有高亲和力、特异性结合的DNA适体,为DNA适体在转基因成分检测中的应用研究奠定基础。本文在对CP4-EPSPS转基因蛋白的SELEX体外筛选过程中,利用反向筛选技术去除可能存在的与靶蛋白相同的结合位点,缩短针对靶蛋白的特异表位的适体富集过程。经过15轮的筛选,对筛选产物进行克隆、测序,并对测序适体进行一级结构和二级结构的分析、结合率以及特异性的测定、比较。SELEX筛选结果表明,每轮的ssDNA富集文库与靶蛋白的结合率呈上升趋势,结合显色后吸光度值从第1轮的0.2257上升到第15轮的1.5132,提高了6.7倍。一级结构保守序列显示分别有4对适体序列完全一致和10对几乎完全相同(其中6对完全一致,其余4对只有1、2个碱基的差别),这说明一级结构同源的适体得到了富集。二级结构模拟图以茎环状结构为主,说明这些茎环状结构是适体与靶蛋白进行结合的基础。适体与靶蛋白的结合实验表明,D04号适体的结合率最大,G02号适体的结合率最小。D04号适体特异性实验显示,D04号适体与CP4-EPSPS转基因蛋白结合后的吸光度值最大,说明D04号适体具有较好的特异性,为后续的应用研究奠定了基础。
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