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当代分子生物学技术的发展，使得上世纪80年代初诞生的古代DNA研究逐步走上科学的发展轨道，成为新兴的多学科交叉研究领域。中国的考古文化遗址众多，其中的古代人类遗骸不仅为人类学研究提供了物质基础，也为古代DNA研究提供了弥足珍贵的财富，使得我们可以通过现代分子生物学技术了解早期先民的渊源、遗传结构以及和现代人群的关系，从而为揭示晚期智人在中国的进化和迁徙历史提供重要线索。
按照学术界公认的古代DNA研究可靠性标准，我们对来自青海大通上孙家寨墓地遗址的人类遗骸进行了科学、严谨的古代DNA分析，获得了可靠的古代DNA数据。从29例个体的牙齿中成功提取到了线粒体DNA并对其单倍群归属进行了准确划分。在可信数据的基础上，对上孙家寨古代人群的母系遗传结构进行了分析。结果显示：2000年前的青海地区居民主要由欧亚大陆东部人群组成，并且与现在的青海人群具有很好的遗传连续性。结合部分古代人群的mtDNA数据，以及考古学和人类学的研究结果，我们推测欧亚大陆西部人群东进的时间早于3500年前，最晚在距今2000年前渐趋式微，达到平衡；东进的最远距离不会超过青海、甘肃地区。
此外，我们从技术层面上对古代DNA的抽提进行了研究，发现抽提阴性并不能如预期地检测到痕量的污染，并提出了相应的改进方法，推进了古代DNA研究的可靠性。