目的：本研究对原发性痛经患者分别采用隔药灸脐针三阴交法和隔药灸脐法治疗，通过检测治疗前后两组患者血浆及尿液的代谢产物，发现潜在的生物标记物，推导其相关代谢通路，籍此探讨隔药灸脐针三阴交法和隔药灸脐法治疗该病可能的有效作用靶点，比较两组的代谢途径及对胞宫调控机理的异同点。方法：选取20名原发性痛经患者，随机分为隔药灸脐针三阴交组和隔药灸脐组，每组10名。对治疗前后两组患者的血浆及尿液进行处理。根据Simca-P11.5软件包的处理数据，通过HMDB、METLIN寻找有贡献的代谢物组分，寻找相关代谢通路。结果：两组治疗原发性痛经的代谢产物均发生了显著变化，其中变化较为显著的为类固醇类、前列腺素类、儿茶酚胺类、组胺类、神经递质类及氨基酸类等代谢物，两组的代谢物共同涉及到体内的类固醇激素合成、前列腺素代谢、儿茶酚胺代谢、组胺代谢、神经递质及氨基酸代谢等过程。此外，隔药灸脐针三阴交法还涉及到体内的一氧化氮合成、催产素代谢及细胞信号转导等过程。结论：①隔药灸脐针三阴交法和隔药灸脐法治疗原发性痛经的代谢组学机制主要是通过调整原发性痛经患者异常的生殖内分泌激素水平，改善其神经、免疫、内分泌网络状况，从而减轻痛经的疼痛程度并改善其伴随症状。②隔药灸脐针三阴交法在缓解痛经方面明显优于隔药灸脐法。③隔药灸脐法与针刺三阴交穴在调控胞宫机能方面具有协同作用。