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蛋白质对生命活动有很重要的作用,构成它最基本的物质是氨基酸。通常生物和化学反应在溶液中进行,尤其是水溶液,进而研究氨基酸二肽的水溶液的结构和性质具有重要意义。本文首先应用ABEEMσπ浮动电荷极化分子力场,采用NVT系综,在温度为298K下对氨基酸二肽的水溶液进行动力学模拟。模拟1 ns后,计算其非氢原子坐标与初始结构相比的均方根偏差平均值,其中非氢原子包括骨架原子、Cα原子、支链原子和重原子。然后使用ABEEMσπ/GB/SA模型计算它们的溶剂化自由能、溶剂化自由能的非极性和极性部分、溶剂可及表面