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胰腺癌是预后较差和死亡率较高的恶性肿瘤之一,其中肿瘤细胞的转移是造成胰腺癌患者死亡的主要原因。胰腺癌中某些细胞能够突破基底膜、渗透至血液中,并伴随循环系统迁移至其他组织或器官,这些细胞被称为循环肿瘤细胞(Circulating Tumor Cells,CTCs)。近年来的研究发现,CTCs在患者液体活检中具有重要的预后意义。不仅如此,越来越多的证据表明,CTCs作为肿瘤转移的种子,在脱离原发病灶后能够抑制失巢凋亡,在血液循环中抵抗流体剪切力和并躲避免疫监视,其存活现象与内在基因表达机制可能能够为肿瘤治疗和转移阻断提供新的思路。然而,目前关于CTCs的内在机制的研究仍不充分,其中的关键调控因子、不同转录模式、存活和免疫逃逸机制以及关键基因与患者生存的确切关系仍未得到深入的、系统的研究。为了研究胰腺癌CTCs中的关键基因和表达模式,我们首先下载了来自GEO数据库的包含75个胰腺癌CTCs的共187个样本的转录组数据,识别其中未被注释的CTCs特异性的新lncRNA,并通过其表达调控作用及共表达网络的计算,寻找其中起到关键调控作用的lncRNA。基于包含新lncRNA的胰腺癌转录组数据,我们对胰腺癌CTCs的不同类型的表达模式进行识别,并尝试还原不同CTCs类型之间的关系。同时,我们通过2组胰腺癌CTCs转录组数据和3组其他肿瘤CTCs数据,验证所构建的共表达模块的保守性,寻找在不同胰腺癌CTCs中普遍存在的基因表达模式,并获得了3个在肿瘤中普遍存在的表达模块。此后我们进一步引入TCGA、ICGC数据库中的胰腺癌患者表达谱与临床数据,通过生存分析获取CTCs中的重要的的生存相关基因,并构建了一组由胰腺癌CTCs基因构成的具有良好预后效果的生存模型,以进一步从患者生存预后的角度阐释CTCs关键基因的重要性。通过上述分析,我们在胰腺癌CTCs中获得了2026个高置信度的新lncRNA,识别出5种不同的CTCs分组、重现了他们之间的关系、识别出不同类型的CTCs中的Wnt通路等关键信号通路及lncRNA如XLOC054311、XLOC007054、XLOC082573等在共表达调控网络中的枢纽作用。在胰腺癌结果的验证分析中,我们在多组胰腺癌和其他肿瘤CTCs数据中获得了3个保守的共表达模块。通过肿瘤数据与临床信息的结合,我们计算出胰腺癌CTCs中具有预后意义的76个生存相关基因和由ANKRA2,GBP2,KRT19,DOCK9,TRIM46这五个在胰腺癌CTCs中具有保守的表达模式的基因构成的预后模型,并从新鉴定的lncRNA中发现了可能能够有效调控KRT19表达的XLOC011657。这些研究无疑会在靶向治疗、肿瘤转移阻断和CTCs的内在机制研究中起到重要作用。