当前,我国的经济增长方式正在从高速度向高质量转型,而在经济发展过程中,创新一直是不能忽视的关键驱动力。在新的经济形势下,我国经济正面临着结构性下行压力,创新要素的投入十分有限,因此,如何使创新要素的质量得到最大限度的提升、使创新要素的配置效率得到最大程度的优化,成为迫切需要解决的问题。近年来,我国实施了科技兴国战略,在一定程度上提高了我国创新要素的配置效率,但区域间的要素配置仍然存在着明显差距,缩小区域间配置效率差异、提升整体创新要素配置效率愈发重要。创新要素的合理配置是提升创新能力的一个重要条件。因此,研究创新要素错配与区域创新产出的关系具有重大的理论和现实意义。本研究主要基于资源配置效率理论、空间经济学理论、区域创新理论等有关理论与观点,对创新要素错配对区域创新产出的影响效应进行深入探讨。本文以中国大陆30个省份（除了西藏）作为研究对象,测算出2009-2018年的我国创新人力资源、创新财力资源以及创新环境要素的错配指数,运用全局自相关分析了区域创新产出的空间相关性;最后,运用空间计量模型,对创新要素错配对区域创新产出的空间影响效应进行分析。结果显示:首先,近年来,我国R＆D人员、R＆D经费支出以及互联网宽带接入端口数都处于增长态势,但创新要素配置存在地区分布不均的现象,总体表现为东部地区创新资源总量要远高于中西部地区。再次,通过对创新要素错配程度的测算,发现我国各省域创新人力资源、创新财力资源及创新环境要素均存在错配现象。通过纵向比较,可知2009到2018这十年来我国各省域的人力资源及财力资源错配程度有轻微缓解,而创新环境要素错配程度却有所加重。通过横向比较,可以看出,我国的创新人力资源、创新财力资源及创新环境要素存在地区分配不均的问题,总体呈现出东部地区创新要素资源配置不足,而中西部地区创新要素配置过剩的态势。最后,通过构建空间计量模型,得出创新要素错配对区域创新产出的空间影响效应:不同省域之间的创新产出存在明显的反向空间溢出效应;创新人力资源错配和创新环境要素错配对区域创新产出具有显著的负向的抑制作用,而创新财力资源错配对区域创新产出具有正向的促进作用。基于此,本文提出相关对策建议:一是加大用人体制改革,调动创新人才积极性。二是调整产业结构,推动产业集聚。三是开展产学研一体化建设,促进产学研融合发展。四是发挥政府政策引导作用,提升技术创新效率。