海洋污损微生物鉴定及其特异性扩增方法的初步研究

来源 :哈尔滨工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:andykwok
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在海洋开发过程中,海洋污损生物的附着是一个非常严重的问题。海洋污损微生物是指附着在船底、管道、浮标和人工设施上的微生物的总称。多年来,海洋污损微生物对国防、航运、沿海工厂冷却系统及水产业的危害性已经引起了国内外学者的广泛关注,但是污损早期微生物群落的动力过程和关键步骤却一直不清楚。本研究对威海小石岛海域海洋污损早期微生物进行系统鉴定并根据所鉴定出的菌种设计特异性引物,为研究污损早期微生物群落动态变化提供技术手段。本研究的工作主要可以分为3个部分:海洋污损早期微生物16SrDNA序列分析鉴定;海洋污损早期微生物生理生化研究;海洋污损微生物的特异性引物的设计与筛选。本研究所得实验结论如下:(1)通过16SrDNA序列分析法,初步得到夏季威海小石岛海域污损微生物优势菌群的种类(19种),主要五类优势菌属分别为变形杆菌属(proteobacterium)、红杆菌属(Rhodobacteraceae)、玫瑰杆菌属(Roseovariussp.)、黄杆菌属(Flavobacteriaceae)和交替单胞杆菌属(Alteromonadaceae),分别占总菌(各个菌种出现的次数之和)的13%、10%、10%、9%和8%。(2)经纯培养方法筛选得到海洋污损早期微生物鉴定结果如下:生理生化结果表明16个菌株中均为产荚膜的菌,其中12株菌为革兰氏阴性菌,4株为革兰氏阳性菌。其中14株经活化后有活性的菌株鉴定为四个已知属分别为假交替单胞菌属、变形杆菌属(proteobacterium)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、海单胞菌属(Marinomonas sp.)。14株菌中,8株菌与假交替单胞菌的相似度为99%~100%,3株菌与发光杆菌相似度为99%,1株菌与嗜冷杆菌相似度为99%,1株菌与海单胞菌相似度均为99%。(3)经过16SrDNA序列分析法和微生物纯培养方法得到夏季威海小石岛海域的优势菌属。同时将两种方法进行对比发现,通过16SrRNA序列分析法得到的19种已知菌属囊括了微生物纯培养的方法得到的四种菌属,所以最终确定威海小石岛海域的优势菌属为变形杆菌属、红杆菌属、玫瑰杆菌属、黄杆菌属和假交替单胞杆菌属。16SrDNA序列分析法避免了海洋生物分离培养的困难。(4)本研究筛选出两对海洋污损微生物特异性引物,分别针对海单胞菌属和嗜冷杆菌属有很好的特异性,该两对引物分别能够快速准确地从威海海域海洋污损微生物中区分出海单胞菌属和嗜冷杆菌属。
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