高新技术产业在我国经济中有着非常重要的作用,对我国传统产业有很强的带动作用,是我国经济增长与社会发展的发动机。多年以来,我国相继出台鼓励高新技术产业发展的优惠政策,特别是2008年实施的《中华人民共和国企业所得税法》与《高新技术企业认定管理办法》及配套政策,给与高新技术产业诸多的税收优惠政策,促进了高新技术产业的快速发展,但与此同时,由于隐性税收的存在,导致优惠政策的最终效果存在差异。因此,本文基于市场因素对高新技术企业的税收优惠中的隐性税收问题展开研究,希冀为未来高新技术企业税收优惠政策制定提供政策建议。本文对我国高新技术企业承担隐性税收的问题及其影响因素展开研究,论文共包括五个部分内容,第一部分导论介绍了文章的研究背景和意义,并对国内外有关隐性税收的研究进行了归纳。第二部分理论基础阐述了隐性税收的相关概念和计量模型,并对隐性税收的经济影响展开了理论分析。第三部分分为两个板块,第一板块首先分析了高新技术企业享受的税收优惠政策中的隐性税收,进而对这些税收优惠中的隐性税收进行了分析。第二板块先测算分析高新技术企业市场结构状况,随后分析了高新技术企业不同市场结构下的隐性税收。第四部分实证分析采用了检验非完全竞争市场中隐性税收的方法,并且考虑行业集中度和市场份额等因素,通过对税收优惠的税前当量和企业税前收益率之间相关关系的分析,探讨我国企业承担隐性税收的问题及其影响因素。第五部分通过上述理论分析和实证分析得出两个结论:其一,我国高新技术企业可能普遍存在市场失灵,政府让渡的利益并没有达到全部用来促使行业发展的期望。其二,证实了市场结构确实对企业承担的隐性税收有影响。据此结论给出了建议,对于政府,一是建议完善高新技术企业认定管理办法,二是建议加大对创投企业的优惠力度,三是建议加强高新技术企业税收优惠的管理机制;对于企业而言则建议可以在纳税筹划时考虑隐性税收因素。