顺铂对DNA作用的单分子研究

来源 :中国科学院物理研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:SMXYIMASHI
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本论文主要进行了以下三个方面的研究工作:首先,改进了横向磁镊装置的样品池并编写了一套实验程序;然后,对单分子磁镊实验中用到的一些数据处理方法进行了探讨;接下来,用磁镊和AFM研究了顺铂对DNA弹性和结构的影响。论文中主要取得了以下有意义的研究进展:   (1)改进了横向磁镊的样品池并编写了一套实验程序来控制CCD,进行单分子磁镊实验。这套程序包括两个部分,实验录像程序和录像分析程序。主要解决了将分辨率提高到亚像素,海量实验数据的存储,优化算法提高运算效率等问题。   (2)对单分子磁镊实验中用到的一些数据处理方法进行了探讨,并具体用于对实验结果的分析。这些方法包括DNA拉伸实验的WLC模型拟合、实验数据的数字滤波、自动识别阶跃算法和频率域求解分子马达步长的方法等。   (3)用磁镊和AFM研究了顺铂对单个DNA分子弹性和结构的影响,发现:在低浓度顺铂中,DNA长链上形成了许多弯折从而使DNA分子变软。在高浓度的顺铂中,DNA长链上由于远程交联而形成小环,从而导致DNA缩短。小环之间的进一步交联,将产生更加复杂的结构,直至DNA完全缩短。另外顺铂与DNA之间是一种强结合,不能通过外加一定的拉力(≤20 pN)或者清除溶液中的顺铂使顺铂与DNA脱离。
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