植物抗病基因研究是植物遗传学和植物病理学所关注的热点问题。本文综述部分主要介绍了近十年来植物抗病基因的研究进展，包括抗病基因的克隆方法，抗病基因的分类，抗病基因的结构特点及其功能。此外，还对近年来抗病基因作用机理的研究进行了简要的评述，并讨论了抗病基因的应用前景。 另一方面，生物信息学作为计算机科学与生物学的交叉学科，生物数据库及生物信息分析是其主要研究内容。综述部分概述了核酸数据库、蛋白质数据库及其集成系统，并简介生物信息学在水稻新抗病基因挖掘、比较基因组及功能基因组中研究的现状，最后展望了其发展前景。 在研究论文部分中，对水稻品种Nipponbare中含有核苷酸结合区(NBS)的候选基因进行了全基因组的分析研究，这包括对它们的确认、结构多样性分析、系统发生学关系分析、物理位置分布分析等等，并且对拟南介(Arabidopsis)NBS类型抗病基因分析结果进行对照。我们在水稻品种Nipponbare中找到535个有NBS结构的基因，其中包括了480个非Toll/IL-1受体富含亮氨酸的NBS类型基因(non-TIR-NBS-LRRgene)，而Toll/IL-1受体富含亮氨酸的NBS类型基因(TIR-NBS-LRRgene)，虽然在拟南介中非常的普遍，但在水稻品种Nipponbare中，却一个都未发现。这些non-TIR-NBS-LRR基因占到了整个水稻基因组预测基因数量的1％左右，是拟南介中同类基因的8.7倍。76％的NBS类型基因集中出现在44个基因簇或者57个一前一后的队列中。系统发生学分析的结果也表明，按照它们的结构分类(N端和NBS部分分类)在多达200多个组中并没有出现明显的簇，这与拟南介的分成两大类的结果也大相径庭。结构和基因水平的多样性分化在水稻中异常明显，这一切都证明了多样性选择在这一农作物抗病基因进化中所担当的重要角色。