固本增骨方治疗骨质疏松症的网络药理学研究

来源 :甘肃中医药大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:guhong_2
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目的:基于大数据挖掘固本增骨方防治骨质疏松症的主要活性成分,运用网络药理学构建“药物-疾病-靶点-信号通路”网络,探讨其治疗骨质疏松症的潜在机制和分子学途径。方法:在中药系统药理学数据库TCMSP在线分析平台以“OB≥30%,DL≥0.18和HL≥4.00”作为条件筛选出固本增骨方中黄芪、当归、党参、淫羊藿、熟地黄、肉苁蓉、乌药的有效活性成分,采用人类基因数据库(GeneCards)和人类孟德尔数据库(OMIM)筛选出疾病靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件构建“疾病-中药复方-化合物-靶标”调控网络。利用String软件构建交集靶点蛋白互作网络和条形图,分析蛋白的相互作用关系及核心靶点。使用clusterProfiler R包对共同靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析,得到固本增骨方治疗骨质疏松症核心基因相关的生物功能和信号通路。在BATMAN-TCM数据库中以“Score cutoff≥30,P-value≤0.05”作为条件筛选出君药黄芪、当归,臣药熟地黄、淫羊藿的活性成分及靶点后,以上述同样的方法进行网络药理学分析,预测“黄芪-淫羊藿”、“当归-熟地黄”两组药对治疗骨质疏松症可能的生物学过程以及相关的信号通路。结果:1.在TCMSP平台检索到固本增骨方的核心化合物有57个,包括毛地黄黄酮、8-异戊烯基山柰酚、山柰酚、槲皮素、β-谷甾醇、苏齐内酯、芒柄花黄素、豆甾醇、木犀草素、脱水角蛋白、钙黏蛋白、花生四烯酸盐、异黄酮、菊黄素、丁香酚等,活性成分预测靶点有209个,构建出“复方-活性成分-疾病-靶点”网络后发现固本增骨方治疗骨质疏松症与AKT1、IL6、VEGFA、UN、PTGS2、CASP3、MAPK1、MAPK8、CXCL8、MMP9、EGF、EGFR、MYC、IL1B等靶基因密切相关。GO功能与KEGG通路富集分析结果显示固本增骨方治疗OP可能涉及的GO功能有150个,信号通路148条。2.在BATMAN-TCM平台检索到“黄芪-淫羊藿”活性化合物26个,包括黄芪甲苷Vi、胆碱、尿苷、黄芪甲苷li、羽扇豆醇、硬脂精、大豆皂苷1、乙酸亚油醇酯、黄芪素I、β-谷固醇、洋紫苏碱、甜菜碱、喙果皂甙A、大豆皂酚B、黄芪甲苷V等,预测靶点198个,构建出“疾病-药对-化合物-靶点”网络后发现“黄芪-淫羊藿”药对治疗骨质疏松症与ALB、CREB1、NOS3、PTGS2、TNF、DRD2、ESR1、NR3C1等靶基因密切相关。GO功能与KEGG通路富集分析结果显示“黄芪-淫羊藿”治疗OP可能涉及的GO功能98个,信号通路27条。3.在BATMAN-TCM平台检索到“当归-熟地黄”活性化合物77个,包括十四烷、香芹酚、2’,4’-二羟基苯乙酮、尿苷、β-榄香烯、壬二酸、豆甾醇、维生素B12、维生素B1、2-甲基-十二烷-5-酮、腺嘌呤、胆碱等,化合物预测靶点有468个,构建出“疾病-药对-化合物-靶点”网络后发现“当归-熟地黄”药对治疗骨质疏松症与AKT1、TP53、CREB1、TNF、F2、IL1B、PPARG、PTGS2、AGT、CAT、ESR1、COMT、JUN等靶基因密切相关。GO功能与KEGG通路富集分析结果显示“当归-熟地黄”治疗OP可能涉及的GO功能187个,信号通路75条。结论:1.固本增骨方治疗骨质疏松症具有多分子、多靶点、多途径的调控作用,这与多种入血活性成分之间的交感、联合效应有关。2.AKT1、IL6、VEGFA、UN、PTGS2、CASP3、MAPK1、MAPK8、CXCL8、MMP9、EGF、EGFR、MYC、IL1B属于固本增骨方治疗OP的核心靶基因,以上靶点可能参与核受体活性、转录因子活性、类固醇激素受体活性、细胞生长因子活性、RNA聚合酶调控、DNA结合转录激活、氧化还原反应、蛋白酶水解活性、配受体结合、信号转导等过程发挥生物学效应,涉及糖尿病并发症的AGE-RAGE、流体剪切应力与动脉粥样、IL-17、前列腺癌、TNF、乙型肝炎等信号通路。3.固本增骨方中“黄芪-淫羊藿”药对治疗OP与ALB、CREB1、NOS3、PTGS2、TNF等核心靶基因密切相关,可能参与机体部分酶活性、类固醇结合、铵离子结合、神经递质结合、G蛋白偶联的胺受体活性、血红素结合、辅因子结合、四吡咯结合、羧酸结合、有机酸结合、cAMP结合、胺结合、血清素结合、类固醇激素受体活性、G蛋白偶联的血清素受体活性等过程发挥生物学效应,主要涉及cAMP、神经活性配体-受体相互作用、cGMP-PKG、昼夜节律、钙等信号通路。4.“当归-熟地黄”药对治疗OP的核心靶基因有AKT1、TP53、CREB1、TNF、F2、IL1B、PPARG、PTGS2、AGT,可能通过调节类固醇激素受体活性、核受体活性、转录因子活性、氧化还原酶、G蛋白偶联的胺受体活性、离子门控通道活性、被动跨膜转运蛋白活性、有机酸结合、辅因子结合等生物过程而发挥效应,主要涉及cAMP、cGMP-PKG、钙、流体剪切应力与动脉粥样硬化、类固醇等信号通路。
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