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我国山丘面积占国土总面积的2/3左右，随着西部大开发战略的实施，山区公路工程得到了长足的发展，山区公路工程深挖路堑与中短隧道可替代方案的优选所考虑的影响因素非常广泛，其中涉及了植物生理学、恢复生态学、土木工程学和岩土工程学等多学科的综合性问题，工程方案优选不仅包括工程结构的强度和安全可靠的问题，同时还涉及社会效益、经济效益和生态环境效益等问题。如何在实际工程中选择一种较为安全可靠、造价合理而且对生态环境影响较小的工程方案，到目前为止优选理论和方法还不够成熟，因此本文主要采用了理论指导、模糊判断、层次分析和生态环境货币化的方法，对山区公路工程深挖路堑与中短隧道可替代方案的优选进行了较为科学合理的分析和研究。本文结合国家科技支撑计划课题“村镇区域空间规划与集约发展关键技术研究（2012BAJ22B00）”中子课题“村镇区域空间规划与土地利用优化技术集成示范（2012BAJ22B06）”的研究任务“基于生态安全的村镇区域发展建设评价技术（2012BAJ22B06-04）”，并结合重庆金山大道西延段花沟隧道工程的地质条件和周边环境进行了考虑生态环境价值问题的深挖路堑与中短隧道方案的优选。本文的主要研究工作如下：（1）搜集并阅读相关文献，综合的概述了深挖路堑和隧道的基本概念，以及每种方案的特点和施工工艺；强调了深挖路堑对生态环境破坏之大而且不易恢复，另外深路堑高边坡存在着较多的安全隐患，因此提出了中短隧道合理替代深挖路堑的想法，并根据具体的工程实例理想的估算出深挖路堑与中短隧道方案可替代的临界挖方深度H0。（2）分析了深挖路堑与中短隧道方案优选中生态环境的价值问题，考虑生态环境价值对工程方案优选的影响。根据合重庆金山大道西延段花沟隧道工程实例和假设的深挖路堑方案的特点，综合的选取了适合山区公路工程深挖路堑与中短隧道可替代方案的优选指标体系，从经济、技术、生态和环境四个方面通过模糊综合评判法和层次分析法进行深挖路堑与中短隧道方案的模糊优选。（3）通过生态环境货币化，把深挖路堑和中短隧道工程建设对生态环境的影响，以生态环境实物型损失的形式统一转化成货币单位参与方案的优选，解决了生态环境因素给予的模糊优选难题。通过最小环境成本法，根据工程造价和生态环境价值损失的权重确定评价成本，根据评价成本的高低确定最优方案。通过两种方法优选的结果得出中短隧道合理替代深挖路堑的理论依据。