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目的:TM6SF2在慢性肝病以及脂质代谢过程中起着重要作用,但其在肝细胞癌中的作用未知,本研究首先利用当前主流肿瘤数据库TCGA,探索TM6SF2在肝细胞癌组织中的表达情况以及临床意义。同时结合生物信息学技术,分析TM6SF2在肝细胞癌中的生物学功能以及与LncRNA、miRNA构成的ceRNA调控网络机制。最后通过向人源肝细胞癌细胞系Huh-7中稳定转染靶向TM6SF2的shRNA,降低TM6SF2在Huh-7中的表达,探索其对Huh-7细胞增殖的影响。方法:利用在线工具挖掘TCGA肿瘤数据库数据,分析TM6SF2在肝细胞癌组织中的表达情况,并探索TM6SF2对肝细胞癌患者生存预后的影响。运用在线工具Broad GDAC Firehose下载TCGA肝细胞癌患者的RNA-seq数据和临床信息,分析TM6SF2与患者一般特征、病理进展以及原发性肝细胞致病危险因素间的关系。同时分析与TM6SF2在肝细胞癌中具有相关性表达的编码基因,运用生物信息学方法进行GO富集分析、KEGG pathway信号通路分析、PPI蛋白质相互作用网络分析,预测TM6SF2潜在的生物学功能。利用在线工具挖掘TCGA肿瘤数据库数据,分别分析与TM6SF2在肝细胞癌中具有相关性表达的miRNA和LncRNA。利用生物信息学方法,以“TM6SF2-miRNA-LncRNA”为ceRNA的分析基础,挖掘TM6SF2与LncRNA、miRNA之间在肝细胞癌中的潜在调控机制。最后我们采用慢病毒包装技术,在Huh-7细胞中稳定转染靶向TM6SF2的shRNA,构建Huh-7 TM6SF2稳定低表达的细胞模型,利用RT-PCR方法测定TM6SF2低表达细胞中TM6SF2 mRNA的表达水平,以检测细胞模型TM6SF2基因的敲降效率。利用CCK-8细胞增殖检测试剂盒检测TM6SF2稳定低表达的Huh-7细胞和对照Huh-7细胞的增殖能力。所有统计学方法及绘图,均采用SPSS 21.0版本以及GraphPad Prism 7版本。结果:TM6SF2在肝细胞癌组织中的表达量与正常肝组织相比显著降低(P<0.01)。与肝细胞癌患者中,TM6SF2低表达组的中位生存时间降低(HR=1.432,Log-rank p=0.0471)。TM6SF2与肝细胞癌患者的BMI、病理分期、组织学分级以及原发性肝细胞癌致病危险因素存在联系(P<0.05)。在肝细胞癌组织中与TM6SF2相关性表达的编码基因共有49个,GO富集分析发现与TM6SF2表达相关基因的功能主要集中在脂肪酸合成、脂肪酸连接酶激活、凝血酶调节等方面(P<0.05)。KEGG pathway信号通路分析发现表达相关基因主要集中在丙氨酸代谢、PPAR信号通路、胆汁分泌等信号通路过程(P<0.05)。针对HCC信号通路研究发现,TM6SF2的表达相关基因参与了肝细胞生长周期、肝纤维化、早期HCC的过程。PPI蛋白质相互作用网络分析提示,APOC3和HAPLN4与TM6SF2直接作用(P<0.05)。筛选出在肝细胞癌中靶向调控TM6SF2的候选miRNA,分别是miRNA-149-3p、miRNA-134-3p、miRNA-3689b-3p(P<0.05,FDR<0.05)。同时分析与TM6SF2在肝细胞癌中表达相关的LncRNA(P<0.01),并且预测了其中与候选miRNA相互作用的候选LncRNA,分别是MIR194-2HG、GABPB1-AS1、LIC00261、MAGI-AS3(P<0.05)。候选miRNA、LncRNA参与TM6SF2 ceRNA调控网络的构建。慢病毒转染靶向TM6SF2的shRNA在Huh-7细胞中正常表达,并成功筛选出稳定表达shRNA的Huh-7细胞系,TM6SF2基因的敲降效率约为80%。CCK-8法的结果显示,TM6SF2低表达抑制Huh-7细胞的增殖(P<0.05)。结论:利用TCGA数据库和生物信息学技术分析,结果显示TM6SF2在肝细胞癌组织中低表达,TM6SF2低表达患者的中位生存期降低,并且TM6SF2与患者的BMI、病理分期、分级以及原发性肝细胞癌的致病危险因素存在关联,是潜在的抑癌因子。但是在细胞实验中,TM6SF2低表达抑制Huh-7细胞的增殖。TM6SF2的生物学功能主要集中在物质代谢方面,提示物质代谢在肿瘤的病理过程中起着重要作用。我们探索了与TM6SF2有潜在作用的LncRNA、miRNA,并为TM6SF2在肝细胞癌病理发展中的作用及机制提供了肿瘤数据和生物信息学的理论支持。