近几年来,韩国“岁月号”触礁翻沉事故、我国重庆籍客轮“东方之星”轮翻沉事故伤亡惨痛,引起社会广泛关注。厦门港港区内客运航线密集,各航线特点鲜明,风险因素差异大,船舶航行风险高,水上通航环境复杂,因此,本文将从水上交通安全主管部门的角度出发,运用公共管理学的理论对厦门港水上客运安全管理进行研究,以提高厦门港水上客运安全管理的水平。作者阅读了大量与水上客运安全管理相关文献的基础,查阅了政府及相关职能部门的文件、工作台账,结合厦门水上客运安全管理的现状,运用水上交通安全致因理论,分析厦门水上客运安全管理存在的不足,找出原因所在,通过对安全管理理论、公共选择理论和新公共服务理论的解读,借鉴国外和其他地区经验,提出了如何加强管理的对策和建议,分别是进一步规范航运企业、客运船舶以及船员的安全管理、规范渡口渡船管理推动老旧客渡船舶淘汰更新、多方位提高海事服务水平杜绝违章运输、建立两岸合作机制针对重点航线制定特殊监管模式。本文运用了公共选择理论,能从根本上解决厦门港嵩屿渡口老旧木质客渡船载客这一客运安全管理中的难点。希望这些对策和建议能为打造海峡两岸往来“黄金通道”,保持辖区安全形势持续稳定,为服务厦门经济发展、服务两岸交往、服务福建自贸区建设提供保障。