创新是当今时代发展的主题，技术创新需要在一定的科学理论的指导下，立足于系统化的社会组织集群，才能够顺利实现。进入21世纪以来，创新生态系统成为创新理论研究的新范式。本论文从创新生态系统理论分析与梳理入手，论述创新生态系统的概念、含义、结构、特征及其功能，明确提出创新生态系统是一个由相互联系、相互适应、协同整合、共生演化的多重创新要素组成的，具有动态性和网状结构特征的开放性复杂系统。然后，本文以中国转基因技术产业化为对象，分析中国转基因技术研究及其产业化的历史，在创新生态系统理论的视角下探讨中国转基因技术产业化的主要特点、系统结构和存在问题。接着，在创新生态系统理论研究和中国转基因技术产业化的实践经验基础上，本文提出产业创新生态系统的概念并将其概括为：在多种创新行为的综合影响下，为进行创新活动而结成创新网络并与外界环境相互作用而形成的具有创新生态系统特点的产业系统。进一步对产业创新生态系统的构成及其运行机理进行了分析，构建了产业创新生态系统的规范化模式。最后，本文将产业创新生态系统规范化模式同我国转基因技术产业化的现实需要相结合，从树立四大基本理念、增强自主创新能力，优化系统运行机制和提供全面有力支持等方面提出中国转基因技术产业创新生态系统的优化措施。