水稻生物学数据库的构建

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高产、优质与多抗水稻新品种的选育和推广是实现我国粮食安全的重要途径。目前水稻育种工作多数情况下仍然是建立在表型选择和育种家的经验之上,育种效率不高,为了让育种工作者分享水稻分子生物学带来的有效信息,笔者开发了基于Ontology的数据整合技术,并构建了水稻生物学数据库平台。以水稻数据资料检索为核心,水稻生物学数据库整合了与育种相关的各类生物数据,实现了水稻综合信息资源的共享。内容上,该平台建立了一个关系型数据库集群,主要包括水稻分子标记数据库、水稻基因(含QTL)数据库、遗传图谱数据库、品种(含优异种质)数据库、参考文献数据库和Ontology系统,并以此为基础,借助Microsoft的VML程序做了些数据库的二次开发和应用,如构建水稻品种DNA指纹鉴定数据库和进行水稻QTL图谱整合研究等;技术上,本数据库采用流行的ASP.net技术设计,SQL SERVER2005为底层数据库,VB.net为程序语言。水稻生物学数据库的构建,建立了生物数据和育种需求之间的桥梁,不仅为育种家进一步提高水稻育种效率提供数据支撑,也为分子生物学家了解生物数据与相关农艺性状的关系提供渠道。
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