辽宁部分地区Potyvirus病毒的鉴定及基因多样性分析

来源 :沈阳大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:yan19891989
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究通过透射电镜观察和RT-PCR扩增技术对辽宁四种植物样品中病毒进行了鉴定。确定侵染南瓜、臭椿、龙葵和番茄的病毒均属马铃薯Y病毒科的马铃薯Y病毒属,分别为小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)、西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)、辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)和马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)。本研究丰富了辽宁地区植物病毒资源,为植物病毒防治工作奠定理论基础。(1)小西葫芦黄花叶病毒(ZYMV):从辽宁省沈阳市和盖州市分别采集表现花叶的南瓜样品,经透射电镜负染色实验,观察到典型Potyvirus线性粒子。利用Potyvirus通用引物PVY-Legpoty-F/R分别对3个沈阳样品和3个盖州样品进行RT-PCR扩增,得到预期片段,克隆并测序。Blast比对结果表明,3个沈阳样品及3个盖州样品之间,同ZYMV的同源性高达99%。利用已经报道的特异引物ZYMV-CP-F/R从6个样本中扩增到约1.2kb的ZYMV片段片段包含完整的外壳蛋白基因(coat protein,cp)。基于cp的核苷酸同源性进行序列分析,得出ZYMV辽宁沈阳分离物、ZYMV-LNgz同山西ZYMV-[CN:SX:Chrysanthemum:14](KP742962)同源性最高,达99.1%和99.4%。系统进化树分析表明2个ZYMV辽宁分离物与山西分离物ZYMV-[CN:SX:Chrysanthemum:14]聚集在一个分支,推测ZYMV-辽宁分离物与山西分离物亲缘关系最近,证明该地区南瓜花叶病病原为ZYMV。(2)西瓜花叶病毒(WMV):2016年8月,在辽宁省盖州市采集到表现花叶的臭椿样品。透射电镜负染色观察到病中存在800nm×18nm的线性病毒粒子。病叶超薄切片结果显示具有大量囊泡和线性聚集体。利用PVY-Legpoty-F/R分别对3个辽宁盖州臭椿花叶样品进行RT-PCR扩增并得到750bp阳性片段。经Blast搜索,与西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)高度同源。利用WMV-5NF/WMV-5NR、WMV-MNF/WMV-MNR和WMV-3NF/WMV-3NR三对引物扩增WMV全基因组,测序为10070核苷酸(MF418043),可切割成10个成熟蛋白。基于cp基因氨基酸序列进行同源性分析,发现盖州臭椿分离物与北京臭椿分离物同源性最高,为93.3%。系统进化树分析,显示WMV辽宁臭椿分离物与已经报道的WMV分离物聚类在一个分支。这是辽宁臭椿上WMV分子特征的首次报道。(3)辣椒脉斑驳病毒(ChiVMV):2016年10月,在辽宁沈阳采集到黄斑驳症状的龙葵样品。利用PVY-Legpoty-F/M4经PCR扩增得到737bp阳性片段,测序确定为ChiVMV病毒。利用ChiVMV特异性引物ChiVMV-CP-F/ChiVMV-CP-R对龙葵黄斑驳样品cDNA进行扩增,得到1103阳性片段,包含完整的cp基因,cp序列大小为863bp,编码287个氨基酸。基于ChiVMV-cp基因进行同源比对,ChiVMV-LNsy-Longkui分离物cp与中国四川番茄分离物(ChiVMV-[CN:SC:CD:Lycopersicon esculentum:13],KF738253)同源性最高,为98.6%。该病毒首次在龙葵上被发现。(4)马铃薯Y病毒(PVY)2015年8月,在辽宁盖州采集表现黄化症状的番茄样品。利用PVY-Legpoty-F/R对提纯的RNA样品合成的cDNA进行PCR扩增,获得约750bp基因组片段。分子克隆后送出测序,结果表明该片段实际大小为675bp。同源性分析结果显示,该片段与马铃薯Y病毒(PVY)同源性最高。确定番茄黄化样品的病原是PVY辽宁分离物。
其他文献
稷下学宫和柏拉图学园分别是古代中国和希腊在公元前4世纪末创建的学校,稷下学宫中担任先生的是有学之士,而柏拉图学园的教师则是“爱智慧”的哲学家。有学之士和哲学家并非
艾草在我国具有悠久的药用历史,现市场上原料多为人工种植。本文针对艾草人工种植中常见问题进行了标准化研究,包括选地、整地、施肥、整畦、种苗繁殖、定植以及田间管理等方
寻求有效的书面作业评价方式是促进学生学习的实践诉求,也是一个亟待解决的专业问题。通过对几种常用的书面作业评价结果反馈方式进行实证研究发现,评语式反馈是有效地促进学
2009年的国际金融危机对我国大部分煤炭行业的影响基本上表现在上游钢材行业需求一直下降,货物进出口的业务格局有了显著改变。总体来说,煤制品总量需求减少,相应价格较低,煤
在"大众创业,万众创新"时代浪潮下,高校高度重视大学生创新创业,特别是大学生创新创业的课程化建设更是受到广泛关注。本文试图阐述大学生创新创业课程化的必要性,分析高校大
生命教育是教育理念在教育中的反映和体现,其目的在于培养人对生命的反思与再认识。对生命进行深层次的理解和把握,将会对人的一生发展及其价值的实现产生深远的影响。生命教
青少年国学教育是值得重视的民族教育、素质教育、和谐教育,它拥有广阔的发展空间,也亟需解决实施原则、操作方法等方面的诸多实际问题。国学教育要从娃娃抓起,在现行教育体
<正>北京工大建国饭店是一家由北京工业大学投资兴建,全权委托首旅集团下属的首旅建国酒店管理有限公司管理的豪华商务饭店。北京工大建国饭店座落于环境优美的北京工业大学
《文化资本——论文学经典的建构》是20世纪八九十年代美国经典论争中的重要学术著作。该书从文学社会学的角度来探讨文学经典作为文化资本的存在方式和消费限制。阶级是《文