企业并购作为企业资源整合的一种有效手段,实现了企业的飞跃增长和快速发展,在企业战略发展和产业升级中起到重要作用。并购目标企业的正确选择是并购成功的关键,因此,对并购目标企业选择的影响因素分析具有重要的实践价值。近年来,我国医药行业发展迅速,成为发展最快的行业之一,有着巨大的发展潜力,然而我国的医药企业总体数量多、规模小、总体效益不高、研发能力薄弱,这种局面并将不能适应新的时代发展,并购整合是我国医药行业的必然选择,随着我国资本市场的不断深化改革与快速发展,尤其是股权分置改革以来,我国医药行业的整合也获得了难得的历史机遇。因此,近年来我国医药行业的整合并购开展得如火如荼。基于我国医药行业,探索我国医药行业并购目标企业选择的影响因素分析具有重要的意义。本文从企业层面基于并购动机理论研究并购目标企业选择的影响因素,首先总结了并购动机理论,并梳理了国内外关于并购目标企业特征、医药行业并购的相关研究。在前人研究成果的基础上,结合中国医药行业实际情况,运用规范研究和实证研究相结合的方法,首先阐述我国医药行业并购目标企业选择的影响因素,提出研究假设并进行实证分析。本文共提出企业规模小、管理无效率、增长-资源不平衡、高财务杠杆、无形资产比率高、企业价值被低估、股权分散、国有股比例低、股权流动性高的九个假设,选取股权分置改革后最有时效的我国A股市场上2007-2011年被并购的医药行业上市公司作为目标样本,未被并购的上市公司作为对照样本,进行显著性分析、因子分析、Logistic回归分析,并对回旯模型的整体系数有效性进行了检验,该模型通过了Hosmer-Lemeshow拟合优度的检验,回代检验预测的整体准确率为70.7%,说明该模型有较强的解释力。企业规模小、管理无效率、高财务杠杆、股权分散假设得到验证,并购目标是低增长-低资源的企业,而企业价值被低估、无形资产比率不是并购目标企业选择的主要影响因索。最后,本文根据实证结果,提出几点对策建议：我国医药行业企业在并购中要注重目标企业价值评估,应建立财务预警系统,防止被恶意并购,同时要提高自主创新能力；完善我国证券市场的法律和监管体系,加强对中介机构的培养和规范,加强投资者教育,提升投资者的整体素质。