VMP1在脑胶质瘤组织中的表达及其与患者预后的关系

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目的:分析VMP1在脑胶质瘤组织中的表达情况以及其与患者预后关系,并探索其潜在的作用机制。方法:1、分别获取TCGA数据库、CGGA数据库、Gravendeel数据库中脑胶质瘤患者VMP1 m RNA表达数据和临床病理参数进行数据分析,采用u检验及单因素方差分析(ONEWAYANOVA)比较脑胶质瘤与正常脑组织中VMP1的表达差异及VMP1与脑胶质瘤WHO分级及重要分子病理亚型之间的关系,运用Kaplan-Meier生存分析及log-rank检验评估VMP1高、低表达组间总生存期(OS)的差异;利用单因素、多因素Cox比例风险回归模型分析确定脑胶质瘤患者独立预后因素,基于独立预后因素以CGGA数据集作为训练组构建的预测脑胶质瘤患者生存率的列线图预测模型(Nomogram),用以预测患者1、3和5年的生存率,TCGA和Gravendeel数据集作为外部验证组进行验证,应用C指数、ROC曲线及校正曲线评价列线图的预测效能。通过TCGA数据库,按|log FC|>1.5,P<0.05筛选出VMP1高、低表达组的差异表达基因,并进行GO富集分析探索其潜在的生物学功能。2、收集2013年1月-2019年12月在广西医科大学附属肿瘤医院神经外科治疗的63例脑胶质瘤患者石蜡组织,通过免疫组化染色检测VMP1蛋白表达,验证VMP1在低级别脑胶质瘤(LGG)与高级别脑胶质瘤(HGG)组织中的表达情况及其与患者预后的关系。结果:1、VMP1 m RNA在脑胶质瘤组织中的表达水平明显高于正常脑组织,差异具有显著统计学意义(P<0.05)。VMP1在脑胶质瘤随着WHO分级增高其表达增加,各级间表达水平具有显著差异(P<0.05)。与IDH突变型相比较,IDH野生型脑胶质瘤VMP1 m RNA表达水平明显升高,差异具有统计学意义(P<0.05)。多因素Cox回归分析结果显示年龄、WHO分级及VMP1表达是影响脑胶质瘤患者总生存期(OS)的独立危险因素;通过列线图模型计算CGGA训练组、TCGA和Gravendeel验证组C指数分别为0.754、0.831和0.694;在CGGA数据集中,模型预测1、3、5年生存率的ROC曲线下面积AUC值分别为0.760、0.812和0.790,Gravendeel数据集则分别为0.665、0.759和0.727,TCGA数据集则分别为0.815、0.812和0.735;校准曲线显示模型预测各队列结果与实际观察结果具有较高的一致性。TCGA中VMP1高、低表达组筛选出933个差异表达基因,GO富集分析结果显示VMP1可能与胶质瘤细胞的粘附、迁移侵袭能力相关。2、VMP1在高级别胶质瘤组织中的表达明显高于较低级别胶质瘤(P<0.001);VMP1高表达的脑胶质瘤患者总体生存期明显短于VMP1低表达的脑胶质瘤患者(P=0.004)。结论:1、VMP1在脑胶质瘤组织中呈高表达,WHO分级越高,其表达水平越高;2、年龄、WHO分级和VMP1表达情况是影响胶质瘤患者OS的独立危险因素;3、构建综合VMP1表达与临床病理特征的列线图预测模型具有良好的预测效能;4、VMP1可能通过影响胶质瘤细胞迁移、侵袭等促进脑胶质瘤发生发展。
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