虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)MAPKK基因家族结构及表达分析

来源 :中国海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:YANCONG1103
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
有丝分裂原活化蛋白激酶MAPK(Mitogen-activated protein kinase)信号通路将细胞外刺激逐级传递至细胞内部,诱导产生一系列的细胞反应,调控细胞活动和免疫反应。MKK将上游MKKK信号整合传递至下游MAPK,被认为是MAPK信号通路的关键节点。本文利用生物信息技术对虾夷扇贝MKK基因进行了基因组和转录组筛查,并对其系统发生关系进行了分析。研究结果表明,虾夷扇贝基因组共含有5个MKK基因(PyMKK),其中PyMKK5含有特殊的Gln重复,同一MKK在物种间的保守性高于同一物种内不同MKK家族成员间的保守性;在虾夷扇贝胚胎幼虫各发育阶段、成体各组织中均检测到5个PyMKK基因的表达;细菌胁迫后,虾夷扇贝血细胞中5个PyMKK基因的表达量均发生显著改变,部分基因间的表达量变化呈显著相关。主要研究结果如下:1虾夷扇贝,MKK基因家族结构分析本研究通过全面筛查虾夷扇贝基因组和转录组数据,获得虾夷扇贝MKK家族全部基因,包括五个成员,PyMKK1/2, PyMKK4, PyMM5, PyMK3/6和PyMKK7,其开放阅读框(Open reading frames, ORF)分别为1206,1143,1401,]107和927 bp,分别编码401,380,466,368和308个氨基酸:理论分子量分别为44.40,43.69,53.21,41.69和35.21 kDa;等电点p1分别为6.35,6.28,5.44,7.05和8.20。进化分析和蛋白分析结果表明:PyMKK与其它软体动物MKK聚类为单独亚支,其次与其它无脊椎动物MKK聚类。MKK在物种间的保守性高于家族间成员的保守性。PyMKK在结构上也高度保守,相关的保守功能位点包括:MAPK对接位点,PyMKK1含2个,PyMKK4含2个,PyMKK5含1个,PyMKK3/6含1个,PyMKK7含1个;14-3-3蛋白家族作用结构域,PyMKK1/2含4个,PyMKK5含1个,PyMKK3/6含1个。功能结构保守的结构基元包括:GxGxxGxV结构基元,包裹ATP的α、γ-磷酸基团;亚结构序列HRD KxxN,催化环内提供质子受体,螯合Mg2+;VAIVK, DFG和APE基元,调控ATP反应和MKK结合;MKK5特有的PB1(Phox and Beml)结构域,介导蛋白间的二聚化实现信号传递。2虾夷扇贝MKK时空表达及其在细菌胁迫后的表达变化分析虾夷扇贝MKK在胚胎及幼虫发育时期呈现出三种表达模式,在壳顶幼虫至眼点幼虫的变态时期,PyMKX的表达水平均相对较低。在成体虾夷扇贝各组织中,PyMKK在外套膜,鳃丝,肉柱和血细胞的表达量较高,在肝胰腺,性腺,足和眼呈现低表达。在藤黄微球菌和鳗弧菌胁迫侵染后,pyMKK呈现表达水平变化,在鳗弧菌侵染下的变化相比藤黄微球菌更为明显,但在细菌侵染的急性期的表达模式相似,变化差异主要表现在侵染后24h,表明其在扇贝免疫反应方面可能发挥作用。研究成果丰富了对海洋贝类MKK及MAPK信号通路的认识,为深入研究MKK在贝类免疫反应中的作用机制打下了基础。
其他文献
海能量是一种新型高效杀菌剂,本文研究了其对水质理化因子的改善、对有害藻的去除、对养殖生物的毒性及对养殖水体中有害病菌的去除效果,评价了其在对虾养殖中的应用效果。主要研究结果如下:1.海能量的最佳使用浓度为250 mg/L,在此浓度下,水质指标好转,水体污染有所缓解。使用海能量5~10 min后,水中亚硝酸盐氮、铵氮和硝酸盐氮显著下降,最大降低率分别可达40.3%、36.7%和24.2%;pH略为增
期刊
病害一直困扰着对虾养殖业的发展,解决对虾养殖业过程中病害爆发的根本策略之一就是提高对虾自身的免疫机能。a-肽聚糖作为免疫增强剂用于提高凡纳滨对虾的非特异性免疫力、增
本文基于2011年1月、3月、5月、7月、9月和11月六个月在青岛湾潮间带6个站位进行大型底栖动物采样所得样品及数据,对青岛湾潮间带进行了生态学研究。研究内容包括大型底栖动物
吴昌硕(1844-1927年),原名俊,又名俊卿,中年以后更字昌硕,亦署仓硕、仓石、苍石、昌石,69岁后以字行,别号缶庐、苦铁、大聋等,浙江安吉人。吴昌硕是近代中国最杰出的艺坛巨匠
为梦而战,你是最棒的!8月,中国奥运健儿们挥汗如雨只为初战得胜8月,金牌培训师选手们积极应战人生没有白走的路,这样的经历也是财富,不同的舞台,相同的执着未来的你定会感谢
牙鲆(Paralichthys olivaceus)为冷温性底栖鱼类,是我国重要的经济鱼类。近年来,随着高密度集约化养殖规模的扩大,鱼类疾病的传染也日益严重,养殖场中鱼类大规模的死亡及其造
陆相断陷湖盆是一类重要的含油气盆地类型,断陷湖盆层序地层学也是目前层序地层学的一个重要研究领域和方向。对孔南地区断陷盆地早期孔店组进行层序地层与储层研究是该区进一
学位
Under the shadow of the financial crisis, the year 2009 presented numerous signs that the world is polarizing in terms of power balances, strategic readjustment
以紫薇品种‘金薇’和‘金薇’野生型为试材,利用透射电镜观察比较了供试‘金薇’及其野生型叶肉细胞内叶绿体和线粒体的超微结构,测定了不同时期叶片中的叶绿素、类胡萝卜素