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水生植物是浅水湖泊生态系统的关键生物,其附着细菌不仅直接影响水生植物的生长发育,而且对营养元素的生物地球化学循环过程有重要影响。研究水生植物附着细菌,对于深入理解富营养化湖泊生态系统的结构及功能具有重要意义。以太湖、洪泽湖的篦齿眼子菜、菹草、金鱼藻等典型水生植物的附着细菌为研究对象,综合运用TRFLP技术,高通量测序等分子生物学手段,研究宿主植物种类、龄期及空间等因素对附着细菌及浮游细菌群落结构的影响。主要结论如下:(1)篦齿眼子菜不同生长阶段附着细菌共检测出38个细菌门,361个细菌属。变形菌门是最主要的细菌门类(平均相对丰度约59%,下同),其中γ变形菌纲的平均相对丰度约35.9%,当植物完全衰亡阶段,γ变形菌纲的相对丰度甚至达到了 42.3%。此外,相对丰度较高的细菌门类还包括拟杆菌门(11.1%)、放线菌门(9.7%)、厚壁菌门(7.7%),蓝细菌门(7.2%)。而在属的分类水平上,假单胞菌属(11.8%-22.00%)和黄杆菌属(5.40%-7.80%)是最占优势的细菌属。(2)太湖和洪泽湖金鱼藻附着细菌样本共检测出52个细菌门,488个细菌属。洪泽湖金鱼藻附着细菌中主要优势细菌包括γ变形菌纲(29.8%),放线菌门(16.8%)、α变形菌纲(11.7%)、β变形菌纲(10.1%)。太湖金鱼藻附着细菌中优势细菌依次为蓝细菌门(29.7%)、放线菌门(13.4%)、β变形菌纲(12.7%)、α变形菌纲(10.9%)。太湖金鱼藻附着细菌样品中,相对丰度最高的5个属分别为假单胞菌属(6.20%)、黄杆菌属(5.34%)、聚球藻属(1.04%)、南极适冷菌属(0.91%)、芽孢杆菌属(0.84%)。洪泽湖金鱼藻附着细菌样品中,相对丰度最高的5个属分别为黄杆菌属(4.64%)、假单胞菌属(3.96%)、芽孢杆菌属(1.59%)、梭菌属(1.10%)、红杆菌属(0.89%)。(3)沉水植物附着细菌的物种多样性规律如下,篦齿眼子菜典型生长阶段附着细菌多样性由高到低依次为:植物衰亡初期、旺盛生长期、生长初期和完全衰亡期;洪泽湖三种沉水植物附着细菌多样性由高到低依次为:篦齿眼子菜、菹草、金鱼藻;洪泽湖金鱼藻附着细菌及周围水体浮游细菌多样性均高于太湖。(4)基于T-RFs与OUT数比较附着细菌群落结构的差异性。在篦齿眼子菜生命周期中,除生长初期外,各阶段附着细菌群落结构相似度较高,当植物处于生长初期,并没有在叶表形成稳定的附着细菌生物膜;篦齿眼子菜和菹草附着细菌群落结构相似性较高,而金鱼藻与其他两种植物附着细菌群落结构差别很大,三种植物化感活性不同及叶片物理形态差异使其附着细菌表现出一定的宿主选择性;通过太湖和洪泽湖两个季节金鱼藻附着细菌群落结构的比较,我们发现金鱼藻附着细菌在空间上的差异性大于其在季节上的差异。