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暗果蝇种组(Drosophila obscura species group)是进化生物学的模式类群，其起源及系统发育关系一直存在争议。目前至少有8个暗果蝇种组的新种被发现分布于在包括中国南方及马来西亚在内的东洋区高海拔森林地带。以往研究基于形态和DNA序列数据的研究认为东亚地区是该种组旧大陆适应辐射的重要地区之一。而近期在亚洲低纬度的热带地区发现的暗果蝇种组3新种(D. hypercephala，D.hideakii以及D. quadrangula)，为推测暗果蝇种组的在旧大陆的起源地提供了新的资料。
本研究选择了4个线粒体基因片段(COI，COII ND2，Cytb)，4个核基因片段(Adh，28S，Gpdh，Amyrel)，测定了新种宽头暗果蝇D.hypercephala的这8个基因的序列，以及Gpdh和Amyrel基因的部分物种的序列，其它序列信息均从GenBank上获得。通过以上数据的分析探讨了包括宽头暗果蝇及我国5个特有种类在内的obscura种组22个种的系统发育关系，得出了如下结论：
1.obscura种组由旧大陆种类和新大陆种类两个支系组成，且本研究认为其各为单系。
2.新大陆种类affinis亚组和pseudoobscura亚组各为单系群。
3.旧大陆种类由microlabis亚组、sinobscura亚组、subobscura亚组和obscura亚组4个亚组组成，其中sinobscura亚组和subobscura亚组为单系。
4.obscura亚组至少由3个单源的谱系组成，分别为D.bifasciata-D.imaii，D.limingi-D.tsukubaensis和 D.obscura-D.tristis-D.ambigua-D.dianensis-D.subsilvestris。其系统发育关系较复杂。
5.通过对不同构树方法所得结果进行比较，发现宽头暗果蝇与非洲种D.microlabis具有最为接近的系统发育关系。同时，D.hypercephala-D. microlabis同样主要分布在东洋区的D. limingi-D. tsukubaensis形成一个单系，处在系统发育树上在旧大陆种类的最基部。通过分析我们推测亚洲东部温带地区可能是暗果蝇种组的起源地。