当前社会是全球化竞争时代,传统时代以资源、资本要素为导向的竞争模式发生转变,进入以技术创新为导向的竞争模式。近年来,在我国相关政策的引导下,专利密集型产业规模得以扩张,产业创新投入不断增加,但粗放型的增长方式暴露出一系列问题,因而研究其创新效率至关重要。本文运用加权主成分TOPSIS方法,从专利活动投入、专利活动产出和专利活动价值三个维度选取专利密度测度指标,测度我国35个工业大类行业专利密度评价值,对我国专利密集型产业进行界定。将专利密集型产业创新过程划分为技术开发阶段和经济成果转化阶段,运用基于共享投入关联DEA模型,利用2008-2015年我国专利密集型产业8个细分行业面板数据及2010-2015年我国9个省份的面板数据,分别从行业角度和区域角度测度我国专利密集型产业创新效率。通过实证分析,共界定得到8个专利密集型产业。创新效率的测度结果表明:(1)我国专利密集型产业创新效率整体水平不高,整体效率在0.75徘徊;(2)观察期内技术效率始终高于经济效率,当前专利密集型产业科技成果转化能力滞后于技术开发能力;(3)各细分行业创新效率存在显著差异,通用设备制造业,医药制造业,计算机通信和其他电子设备制造业行业创新效率整体表现较好,仪器仪表及文化、办公用机械制造业创新效率整体表现较差;(4)各区域专利密集型产业发展不平衡,中东部地区创新效率高于西部地区,将各省份按两阶段效率划分为四类发展区域:粗放型发展区域、研发型发展区域、集约型发展区域和经济型发展区域。