高等院校是中国科研的主力军，高校之间竞争日益激烈，而竞争的核心之一是科研水平，因此科研在高等院校工作中的地位急剧上升。与现阶段科研在高校工作中的重要地位相应的是，对高校科研水平的评估也日益重要起来。然而同时，外界与高校内部对科研水平评估多有质疑。种种批评归类而言分为两种：一种指向现行高校科研水平评估的外适性，也就是在适应我国高校作为科研活动主体所具有的特殊性质方面的缺陷，一种指向其自洽性，也就是在评估本身理念与方法上的缺陷，尤以后者居多。本文从“科研水平评估”这一核心概念入手，批判借鉴发达国家科研水平评估的先进理念和方法，通过对高校作为科研活动主体的特殊性、科研水平评估方法和时段的分析提出现行高校科研水平评估必须将外适与自洽作为改进策略，即对外符合高校作为科研活动主体的特殊性对内完善自身评估方法，才能达到合理化的改进目标。