在全力推进可再生能源发电产业发展的过程中,需要克服可再生能源发电产业发展面临的发电、上网和市场消纳三大主要障碍,而这三大主要障碍的克服,单纯依靠成本优势和技术进步是不可能实现的,必须进行重大的制度创新。为全力推进可再生能源产业的发展,消除三大主要障碍,实现2020、2030年非化石能源占一次能源消费比重分别达到15%、20%的能源发展战略目标,我国在近期将逐步推进可再生能源配额交易制(RPS)和绿色证书交易系统的建设。基于以上背景和国内外研究现状,本文研究了可再生能源配额交易制对我国经济绩效的影响机理及效果。首先,本文基于制度变迁、产权、交易费用和经济绩效等理论对可再生能源配额交易制做出了经济解释,提出了符合中国国情的可再生能源配额交易制的中国架构和运行机制；其次,探究了可再生能源配额交易制的经济效应,并运用系统动力学探究了可再生能源配额交易制对经济绩效的影响机理；然后,分析了绿电厂商和煤电厂商之间竞争与供需关系及绿证市场和电力市场间复杂的交互作用,构建了基于中国电力市场的博弈模型,系统分析了可再生能源配额交易制对经济绩效的影响效果,探讨了发电厂商的横向一体化行为和收益共享机制。最后,基于我国的实证数据,利用Matlab软件编程,模拟仿真出了可再生能源配额交易制的实施对经济绩效的影响效果。研究结果表明：①可再生能源配额交易制实现了可再生能源发电产业发展由固定电价制度的财政补贴向政府政策与市场共同作用的制度变迁。该制度强制地将绿色证书认定为一种经济品,并将使用绿色证书的合法权利分配给绿电厂商,从而使得绿色证书成为一种产权。因为交易费用的存在,且绿色证书的权利界定和分配是明确的,因此,绿色证书交易将会影响市场的资源配置。②根据我国实际状况,配额比例的上下限应设定为(6.897%,39.300%)。③随着政府提高配额比例,绿电厂商发电量将增大,煤电厂商发电量将减少；供电总量增加,上网电价降低；均衡时的绿证价格上升,绿证的交易数量增加；煤电厂商的利润将减少,绿电厂商的利润将增加；生产者剩余减少,消费者剩余增加,社会福利将呈递减趋势。④厂商勾结后的总利润会增多,且煤电厂商和绿电厂商间根据契约分得的利润比独立行动时的利润多,因此,厂商之间有寻求一体化合作的趋向,以实现利益共享。但厂商间的勾结行为,使得供电总量变少,上网电价升高,社会福利降低,绿证市场失灵,绿证价格不再由市场供需决定。随着政府不断提高配额比例,供电总量降低,上网电价增加,社会福利下降,影响电力市场的正常运行。政府在制度设计时,应防止市场可能出现的勾结行为,对厂商间的勾结行为予以处罚。