我国农业的发展在社会化的发展进程中仍然处于滞后地位,为加快实现中国现代化,农业现代化应当作为我国目前的首要任务,而农产品企业的发展为实现农业现代化起了主导作用。随着社会和经济的不断发展,供应链之间的的竞争已经逐渐取代了企业之间的竞争。供应链效率评价有助于揭示和发现供应链网络结构中影响运行效率的关键节点和关键子链,探索改进供应链耦合机制和运行效率的途径和方法,对于实现农产品供应链资源配置最优化,优化供应链结构以及提高农业产业链综合效率有着极其重要的促进作用。目前,国内农产品供应链效率评价的相关研究已经取得一系列进展,包括层次分析、模糊评价、神经网络、数据包络分析等多种综合评价方法都得到成功的应用,但这些研究仍然存在一些局限性和亟待改进的地方。一是针对供应链综合评价指标体系不够全面、系统,评价指标侧重于整体投入、产出数据,难以全面反映供应链内部各环节和主体间物质流、资金流等对整体效率的影响;同时评价指标局限于基于统计数据的数值型变量,忽略了生态农业发展中的环境指标以及品牌效益、消费者满意度等重要定性变量。二是评价方法难以真正适应供应链的网络结构本质特征,对于供应链内部各节点和主体之间的相互作用和制约以及对整体运行效率的影响缺乏深入、细致的剖析和讨论,难以从评价结果中获取更多具体实际经济学意义的指标和数据,难以从评价结果中得到改进效率的具体方法和实施途径。针对以上问题,本文采用网络数据包络分析(NDEA,Network Data Envelopment Analysis)这一数据包络分析领域最新研究方法构建农产品供应链效率综合评价模型。首先针对典型的农产品产业链构成确定供应链关键环节和主体,构建了农产品供应链网络结构,明确了代表各主体和节点间物质流、资金流等相互关系的中间变量和过渡变量;在此基础上根据供应链网状结构建立了效率评价指标体系;然后,构建了基于松弛变量的网络结构数据包络分析综合评价模型NSBM(NSBM——Network Slacks-Based Model)。该模型为非径向综合评价模型,其目标函数集结了所有输入、输出指标对应的松弛变量,克服了传统DEA模型要求输入或输出变量同比例变化的限制条件,是基于输出以及基于输入模型的统一形式,具有更广泛的适用性。该模型量化了供应链各环节间中间变量、过渡变量及其对整体效率的影响,同时还嵌入了针对生态农业建设的环境变量,将模型扩展到同时具有期望和非期望输出的情形。在此基础上,本文进一步将单期的网络DEA评价模型NSBM扩展到基于面板数据的动态网络DEA评价模型(Dynamic NSBM),并给出了农产品供应链各个节点、各个时期以及整体运行效率的评价指标与评价方法。最后,本文以我国十个典型的农业企业和集团为决策单元进行了实证分析。利用企业年报、农业年鉴等数据进行上述评价模型的应用和结果对比分析。不仅科学、客观的给出了各供应链主体环节以及整体运行效率的评价与排序,还能够剖析和确定供应链效率提高关键点和关键环节,分析影响效率的关键变量和影响作用的传导机制,对改进供应链整体效率提供切实可行的途径和方法。本文还通过模型对比分析、敏感度分析等论证了该模型的有效性和稳健性。本文的研究将有助于推动供应链管理理论以及实践应用的发展。